27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5656 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5656  KilA domain protein  100 
 
 
279 aa  568  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1443  hypothetical protein  60.29 
 
 
274 aa  325  4.0000000000000003e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.450311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3302  hypothetical protein  55.72 
 
 
273 aa  298  6e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3542  hypothetical protein  57.41 
 
 
274 aa  298  9e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.566225  normal  0.0498158 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0480  hypothetical protein  55.98 
 
 
271 aa  291  6e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0652  KilA domain protein  54.31 
 
 
267 aa  290  2e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00871  hypothetical protein  54.04 
 
 
273 aa  286  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1576  KilA domain protein  54.51 
 
 
279 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0556  hypothetical protein  51.48 
 
 
275 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2549  hypothetical protein  52.55 
 
 
279 aa  268  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.953779  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1228  hypothetical protein  54.29 
 
 
286 aa  263  2e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000185797 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0343  KilA domain protein  47.64 
 
 
279 aa  246  2e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3883  KilA domain protein  46.27 
 
 
290 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13443 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1392  hypothetical protein  48.46 
 
 
132 aa  127  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0108941  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0736  hypothetical protein  43.41 
 
 
150 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.19722  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3887  KilA domain protein  43.44 
 
 
197 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.143195 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0849  hypothetical protein  41 
 
 
162 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.103296  normal  0.820671 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2517  hypothetical protein  41.98 
 
 
118 aa  70.1  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0917  hypothetical protein  45.07 
 
 
77 aa  65.5  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119531  hitchhiker  0.000000334371 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1359  hypothetical protein  46.27 
 
 
118 aa  63.5  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.477987  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1262  hypothetical protein  40.54 
 
 
80 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.157552  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0617  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  28.93 
 
 
267 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4001  AntA/AntB antirepressor domain protein  39.51 
 
 
280 aa  52  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0973  DNA-damage-inducible protein D  36.84 
 
 
362 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.965716  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1787  hypothetical protein  57.58 
 
 
82 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00700854  normal  0.539633 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3884  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  42.19 
 
 
269 aa  45.4  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1747  hypothetical protein  51.28 
 
 
64 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>