25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3302 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3302  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541654  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1443  hypothetical protein  57.72 
 
 
274 aa  342  4e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.450311  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2549  hypothetical protein  59.77 
 
 
279 aa  337  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.953779  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1576  KilA domain protein  57.47 
 
 
279 aa  329  3e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3542  hypothetical protein  57.2 
 
 
274 aa  325  5e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.566225  normal  0.0498158 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1228  hypothetical protein  55.27 
 
 
286 aa  311  9e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000185797 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00871  hypothetical protein  56.2 
 
 
273 aa  311  9e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0556  hypothetical protein  53.51 
 
 
275 aa  310  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0652  KilA domain protein  55.43 
 
 
267 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5656  KilA domain protein  55.72 
 
 
279 aa  298  6e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0343  KilA domain protein  53.64 
 
 
279 aa  294  1e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0480  hypothetical protein  55.94 
 
 
271 aa  293  2e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3883  KilA domain protein  52.73 
 
 
290 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13443 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0736  hypothetical protein  54.24 
 
 
150 aa  143  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.19722  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1392  hypothetical protein  50.38 
 
 
132 aa  133  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0108941  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0849  hypothetical protein  53.45 
 
 
162 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.103296  normal  0.820671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3887  KilA domain protein  45.61 
 
 
197 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.143195 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2517  hypothetical protein  55.42 
 
 
118 aa  96.7  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1262  hypothetical protein  60.27 
 
 
80 aa  96.3  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.157552  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1359  hypothetical protein  54.05 
 
 
118 aa  87  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.477987  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0917  hypothetical protein  50.72 
 
 
77 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119531  hitchhiker  0.000000334371 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1747  hypothetical protein  65 
 
 
64 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292761  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0396  gp79  32.09 
 
 
228 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  hitchhiker  0.0000000000000292927 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3253  KilA domain-containing protein  40.54 
 
 
259 aa  42.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000473609  decreased coverage  0.00000000000000635561 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0655  KilA, N- domain protein  24.44 
 
 
284 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.243495  hitchhiker  0.00000329473 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>