28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3542 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3542  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  568  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.566225  normal  0.0498158 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00871  hypothetical protein  77.48 
 
 
273 aa  438  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0480  hypothetical protein  64.5 
 
 
271 aa  352  5e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2549  hypothetical protein  61.74 
 
 
279 aa  337  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.953779  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0652  KilA domain protein  59.54 
 
 
267 aa  334  1e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3302  hypothetical protein  57.2 
 
 
273 aa  325  5e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541654  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1576  KilA domain protein  60.47 
 
 
279 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1443  hypothetical protein  55.34 
 
 
274 aa  315  5e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.450311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0556  hypothetical protein  54.75 
 
 
275 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0343  KilA domain protein  55.98 
 
 
279 aa  300  2e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5656  KilA domain protein  57.41 
 
 
279 aa  298  9e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1228  hypothetical protein  55.2 
 
 
286 aa  295  7e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000185797 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3883  KilA domain protein  54.85 
 
 
290 aa  285  5e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13443 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0736  hypothetical protein  61.54 
 
 
150 aa  153  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.19722  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1392  hypothetical protein  52.1 
 
 
132 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0108941  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0849  hypothetical protein  51.55 
 
 
162 aa  109  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.103296  normal  0.820671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3887  KilA domain protein  42.24 
 
 
197 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.143195 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1359  hypothetical protein  54.67 
 
 
118 aa  91.3  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.477987  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1262  hypothetical protein  50.63 
 
 
80 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.157552  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2517  hypothetical protein  45 
 
 
118 aa  67  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0917  hypothetical protein  50.85 
 
 
77 aa  61.6  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119531  hitchhiker  0.000000334371 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1747  hypothetical protein  69.23 
 
 
64 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292761  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0973  DNA-damage-inducible protein D  35.35 
 
 
362 aa  52.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.965716  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0617  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  28.36 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1028  hypothetical protein  25.39 
 
 
257 aa  46.2  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.604601  normal  0.514281 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3253  KilA domain-containing protein  48.65 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000473609  decreased coverage  0.00000000000000635561 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0655  KilA, N- domain protein  45.71 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.243495  hitchhiker  0.00000329473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3664  hypothetical protein  58.62 
 
 
211 aa  43.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.778302  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>