25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1443 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1443  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  567  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.450311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3302  hypothetical protein  57.72 
 
 
273 aa  342  4e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541654  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1576  KilA domain protein  59.77 
 
 
279 aa  329  3e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5656  KilA domain protein  60.29 
 
 
279 aa  325  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0556  hypothetical protein  54.71 
 
 
275 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0652  KilA domain protein  54.51 
 
 
267 aa  316  2e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3542  hypothetical protein  55.34 
 
 
274 aa  315  5e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.566225  normal  0.0498158 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00871  hypothetical protein  53.68 
 
 
273 aa  313  1.9999999999999998e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0343  KilA domain protein  53.76 
 
 
279 aa  308  5.9999999999999995e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1228  hypothetical protein  52.17 
 
 
286 aa  306  3e-82  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000185797 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2549  hypothetical protein  54.74 
 
 
279 aa  306  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.953779  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0480  hypothetical protein  56.92 
 
 
271 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3883  KilA domain protein  49.08 
 
 
290 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13443 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0736  hypothetical protein  52.54 
 
 
150 aa  141  9e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.19722  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1392  hypothetical protein  49.6 
 
 
132 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0108941  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3887  KilA domain protein  47.37 
 
 
197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.143195 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0849  hypothetical protein  48.04 
 
 
162 aa  117  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.103296  normal  0.820671 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1359  hypothetical protein  58.33 
 
 
118 aa  103  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.477987  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2517  hypothetical protein  47.95 
 
 
118 aa  77.8  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1262  hypothetical protein  42.65 
 
 
80 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.157552  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0917  hypothetical protein  45.83 
 
 
77 aa  72.4  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119531  hitchhiker  0.000000334371 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1747  hypothetical protein  59.52 
 
 
64 aa  59.3  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292761  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0973  DNA-damage-inducible protein D  37.62 
 
 
362 aa  58.9  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.965716  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0655  KilA, N- domain protein  27.69 
 
 
284 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.243495  hitchhiker  0.00000329473 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0396  gp79  32.79 
 
 
228 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  hitchhiker  0.0000000000000292927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>