23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2549 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2549  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  577  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.953779  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0652  KilA domain protein  60.67 
 
 
267 aa  350  2e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3302  hypothetical protein  59.77 
 
 
273 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3542  hypothetical protein  61.74 
 
 
274 aa  337  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.566225  normal  0.0498158 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00871  hypothetical protein  64.61 
 
 
273 aa  335  2.9999999999999997e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0480  hypothetical protein  62.07 
 
 
271 aa  331  1e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3883  KilA domain protein  57.4 
 
 
290 aa  322  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13443 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1576  KilA domain protein  56.27 
 
 
279 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1443  hypothetical protein  54.74 
 
 
274 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.450311  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0556  hypothetical protein  50.93 
 
 
275 aa  288  9e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0343  KilA domain protein  53.1 
 
 
279 aa  279  4e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1228  hypothetical protein  52.53 
 
 
286 aa  273  3e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000185797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5656  KilA domain protein  52.55 
 
 
279 aa  268  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0736  hypothetical protein  53.39 
 
 
150 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.19722  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1392  hypothetical protein  50.75 
 
 
132 aa  123  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0108941  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0849  hypothetical protein  51.49 
 
 
162 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.103296  normal  0.820671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3887  KilA domain protein  41.74 
 
 
197 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.143195 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1262  hypothetical protein  51.95 
 
 
80 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.157552  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1359  hypothetical protein  55.26 
 
 
118 aa  81.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.477987  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2517  hypothetical protein  43.9 
 
 
118 aa  79.7  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0917  hypothetical protein  50.68 
 
 
77 aa  79.3  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119531  hitchhiker  0.000000334371 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1747  hypothetical protein  60 
 
 
64 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292761  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0396  gp79  30.97 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  hitchhiker  0.0000000000000292927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>