25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1392 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1392  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  275  1e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0108941  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0556  hypothetical protein  59.52 
 
 
275 aa  157  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0652  KilA domain protein  59.84 
 
 
267 aa  152  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0480  hypothetical protein  56.45 
 
 
271 aa  140  6e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1576  KilA domain protein  52.71 
 
 
279 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3302  hypothetical protein  50.38 
 
 
273 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3542  hypothetical protein  52.1 
 
 
274 aa  132  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.566225  normal  0.0498158 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1443  hypothetical protein  49.6 
 
 
274 aa  130  6e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.450311  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3883  KilA domain protein  52.71 
 
 
290 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5656  KilA domain protein  48.46 
 
 
279 aa  127  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2549  hypothetical protein  50.75 
 
 
279 aa  123  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.953779  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1228  hypothetical protein  46.88 
 
 
286 aa  120  7e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000185797 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00871  hypothetical protein  50.43 
 
 
273 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0343  KilA domain protein  47.2 
 
 
279 aa  115  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0736  hypothetical protein  46.22 
 
 
150 aa  110  6e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.19722  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3887  KilA domain protein  40.37 
 
 
197 aa  87  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.143195 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0849  hypothetical protein  42.99 
 
 
162 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.103296  normal  0.820671 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0917  hypothetical protein  50 
 
 
77 aa  74.3  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119531  hitchhiker  0.000000334371 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1359  hypothetical protein  47.54 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.477987  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1747  hypothetical protein  59.52 
 
 
64 aa  57  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000292761  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1262  hypothetical protein  41.18 
 
 
80 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.157552  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2517  hypothetical protein  37.84 
 
 
118 aa  53.9  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0973  DNA-damage-inducible protein D  57.78 
 
 
362 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.965716  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2280  KilA-N domain-containing protein  27.56 
 
 
286 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0187873  decreased coverage  1.7596300000000002e-23 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3664  hypothetical protein  63.33 
 
 
211 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.778302  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>