29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3884 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3884  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  100 
 
 		 269 aa  561  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4001  AntA/AntB antirepressor domain protein  65.31 
 
 		 280 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0617  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  49.81 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  52 
 
 		 383 aa  162  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3574  phage anti-repressor protein AntB  45.69 
 
 		 217 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000190834 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3750  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  55 
 
 		 136 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0465343  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4350  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  45 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1326  hypothetical protein  41.44 
 
 		 230 aa  91.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18998  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37230  Phage anti-repressor protein AntB-like protein  45.61 
 
 		 182 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331791  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1070  AntA/AntB family antirepressor  36.09 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0307  putative phage anti-repressor protein  42.31 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.0000000000107558  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0548  phage anti-repressor protein, putative  42.39 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.19591  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0555  prophage LambdaSa1, antirepressor, putative  37.5 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0879  phage antirepressor protein  41.3 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00137369  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1680  phage-encoded protein  40.54 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0312  phage antirepressor protein  33.58 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000635944  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0321  phage antirepressor protein  33.58 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0409481  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1623  Phage anti-repressor protein-like  31.78 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0455176  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0396  gp79  31.65 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  hitchhiker  0.0000000000000292927 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0851  AntA/AntB antirepressor domain protein  27.69 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1743  AntA/AntB antirepressor domain protein  32.41 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2852  AntA/AntB antirepressor domain protein  32.58 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000203262  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0382  phage antirepressor protein, putative  32.58 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000707014  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1713  hypothetical protein  38.98 
 
 		 114 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.213277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2087  phage antirepressor protein  32.84 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000258428  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2050  phage antirepressor protein  32.84 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.016924  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0647  phage-encoded protein  31.91 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000047659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0585  hypothetical protein  31.91 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5656  KilA domain protein  42.19 
 
 		 279 aa  45.4  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>