16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3750 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3750  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  100 
 
 		 136 aa  273  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0465343  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  242  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0617  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  84.52 
 
 		 267 aa  155  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3884  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  55 
 
 		 269 aa  118  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4001  AntA/AntB antirepressor domain protein  42.61 
 
 		 280 aa  85.5  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1326  hypothetical protein  47.3 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18998  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1070  AntA/AntB family antirepressor  39.76 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3574  phage anti-repressor protein AntB  42.68 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000190834 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4350  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  32.74 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37230  Phage anti-repressor protein AntB-like protein  39.24 
 
 		 182 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331791  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1713  hypothetical protein  44.23 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.213277  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0879  phage antirepressor protein  32.26 
 
 		 257 aa  47.4  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00137369  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0555  prophage LambdaSa1, antirepressor, putative  36.92 
 
 		 249 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1743  AntA/AntB antirepressor domain protein  42.42 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0312  phage antirepressor protein  32.84 
 
 		 250 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000635944  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0321  phage antirepressor protein  32.84 
 
 		 250 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0409481  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>