27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1743 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1743  AntA/AntB antirepressor domain protein  100 
 
 		 115 aa  240  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1623  Phage anti-repressor protein-like  44.68 
 
 		 247 aa  84.3  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0455176  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1680  phage-encoded protein  44.83 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3574  phage anti-repressor protein AntB  37.37 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000190834 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0617  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  42.55 
 
 		 267 aa  74.3  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4350  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  41.86 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1326  hypothetical protein  34.86 
 
 		 230 aa  71.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.18998  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1713  hypothetical protein  55 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.213277  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  42.55 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1070  AntA/AntB family antirepressor  35.92 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37230  Phage anti-repressor protein AntB-like protein  34.69 
 
 		 182 aa  63.5  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331791  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0307  putative phage anti-repressor protein  36.47 
 
 		 226 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  unclonable  0.0000000000107558  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0548  phage anti-repressor protein, putative  40.79 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.19591  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2852  AntA/AntB antirepressor domain protein  30.69 
 
 		 250 aa  61.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000203262  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4001  AntA/AntB antirepressor domain protein  31.54 
 
 		 280 aa  60.8  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0382  phage antirepressor protein, putative  30.69 
 
 		 250 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000707014  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0555  prophage LambdaSa1, antirepressor, putative  31.68 
 
 		 249 aa  60.5  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0879  phage antirepressor protein  37.23 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00137369  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3884  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  32.41 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2087  phage antirepressor protein  33.01 
 
 		 249 aa  53.9  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000258428  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2050  phage antirepressor protein  33.01 
 
 		 249 aa  53.9  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.016924  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0647  phage-encoded protein  30.23 
 
 		 266 aa  53.5  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000047659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0585  hypothetical protein  30.23 
 
 		 266 aa  53.5  0.0000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0321  phage antirepressor protein  31.43 
 
 		 250 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0409481  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0312  phage antirepressor protein  31.43 
 
 		 250 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000635944  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0851  AntA/AntB antirepressor domain protein  30.86 
 
 		 230 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3750  AntA/AntB antirepressor domain-containing protein  42.42 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0465343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>