80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0329 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_0329  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
183 aa  377  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000416142  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3394  acetyltransferase  99.45 
 
 
194 aa  374  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.179299  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3868  acetyltransferase  98.91 
 
 
181 aa  368  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052756  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0197  GCN5-related N-acetyltransferase  66.67 
 
 
182 aa  234  4e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000342044  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0582  GCN5-related N-acetyltransferase  51.81 
 
 
177 aa  181  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4893  tabtoxin resistance protein  50.6 
 
 
177 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4434  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
177 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189949  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3293  GCN5-related N-acetyltransferase  42.44 
 
 
170 aa  124  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00428954  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4104  GCN5-related N-acetyltransferase  41.52 
 
 
170 aa  123  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0181775  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3401  hypothetical protein  41.56 
 
 
177 aa  120  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.737914  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40130  hypothetical protein  42.21 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3927  acetyltransferase  40.13 
 
 
176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4179  GCN5-related N-acetyltransferase  40.76 
 
 
175 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2856  acetyltransferase  41.29 
 
 
167 aa  115  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.72924  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1455  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2588  acetyltransferase  41.94 
 
 
167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00776025  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0092  GCN5-related N-acetyltransferase  39.49 
 
 
182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2553  acetyltransferase  41.29 
 
 
167 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4258  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 
172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2629  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00815719  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2834  acetyltransferase, GNAT family  41.29 
 
 
167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000815753 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2637  acetyltransferase  41.29 
 
 
167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.439574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2828  acetyltransferase  41.29 
 
 
167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.738685  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0098  GCN5-related N-acetyltransferase  38.85 
 
 
182 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2839  acetyltransferase, GNAT family  40.65 
 
 
167 aa  112  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2877  acetyltransferase, GNAT family  41.29 
 
 
167 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0106791  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5473  hypothetical protein  38.46 
 
 
174 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0372371 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0394  GCN5-related N-acetyltransferase  37.25 
 
 
198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.959695  normal  0.199216 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1656  GCN5-related N-acetyltransferase  40.26 
 
 
175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2454  acetyltransferase, GNAT family  39.87 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4523  GCN5-related N-acetyltransferase  38.96 
 
 
172 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31037  normal  0.0470006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1034  GCN5-related N-acetyltransferase  41.56 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0114  acetyltransferase protein  36.09 
 
 
174 aa  108  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2012  GCN5-related N-acetyltransferase  38.06 
 
 
175 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.420393  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3861  GCN5-related N-acetyltransferase  35.84 
 
 
173 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2086  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 
179 aa  104  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477453  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1420  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
176 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1865  GCN5-related N-acetyltransferase  34.1 
 
 
175 aa  102  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00546663  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3472  GCN5-related N-acetyltransferase  37.01 
 
 
173 aa  101  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1066  GCN5-related N-acetyltransferase  35.76 
 
 
168 aa  98.2  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.172049  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1142  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
153 aa  97.8  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.561673  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6126  GCN5-related N-acetyltransferase  37.01 
 
 
196 aa  95.9  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350433  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4479  GNAT family acetyltransferase  35 
 
 
175 aa  95.9  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.89727  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3175  acetyltransferase  33.12 
 
 
175 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0894  acetyltransferase  33.12 
 
 
175 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2020  acetyltransferase  33.12 
 
 
175 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2727  acetyltransferase  33.12 
 
 
175 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1882  acetyltransferase  33.12 
 
 
175 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1427  acetyltransferase  33.76 
 
 
175 aa  92.8  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3138  acetyltransferase  32.12 
 
 
179 aa  92.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3192  acetyltransferase  33.55 
 
 
426 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.722637  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1353  putative acetyltransferase protein  39.1 
 
 
175 aa  88.6  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0472783  hitchhiker  0.00977736 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5268  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
182 aa  88.6  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.90645 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4801  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 
176 aa  88.2  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0191  GCN5-related N-acetyltransferase  34.84 
 
 
176 aa  87.8  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4767  GCN5-related N-acetyltransferase  38.96 
 
 
173 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3322  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 
176 aa  84.3  8e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.954498  normal  0.116948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4811  GCN5-related N-acetyltransferase  35.03 
 
 
176 aa  84.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329045  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5403  GCN5-related N-acetyltransferase  34.39 
 
 
176 aa  84.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5458  GCN5-related N-acetyltransferase  34.39 
 
 
176 aa  84.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0126  GCN5-related N-acetyltransferase  39.35 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136967  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2274  GCN5-related N-acetyltransferase  35.45 
 
 
141 aa  52  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1094  GCN5-related N-acetyltransferase  27.68 
 
 
153 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2489  acetyltransferase  33.88 
 
 
141 aa  49.3  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221724  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05434  acetyltransferase  37.21 
 
 
141 aa  48.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06630  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  33.33 
 
 
155 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300608  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0856  acetyltransferase  39.34 
 
 
147 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.739267  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0869  acetyltransferase  39.34 
 
 
147 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00876898  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2000  hypothetical protein  23.4 
 
 
201 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  33.66 
 
 
291 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3281  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
137 aa  45.4  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.229217  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2225  acetyltransferase  29.86 
 
 
161 aa  45.1  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.533627  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1053  GCN5-related N-acetyltransferase  30.7 
 
 
188 aa  44.7  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3386  GCN5-related N-acetyltransferase  36.71 
 
 
139 aa  44.7  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0869  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
145 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.700495 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3203  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
142 aa  42.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1474  GCN5-related N-acetyltransferase  24.32 
 
 
156 aa  42  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1058  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 
193 aa  41.2  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1003  acetyltransferase, GNAT family  39.68 
 
 
145 aa  41.2  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0377397  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4496  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 
179 aa  40.8  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000087115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>