96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3927 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_3927  acetyltransferase  100 
 
 
176 aa  354  3.9999999999999996e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3861  GCN5-related N-acetyltransferase  51.74 
 
 
173 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1066  GCN5-related N-acetyltransferase  49.69 
 
 
168 aa  155  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.172049  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1656  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 
175 aa  154  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3293  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
170 aa  138  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00428954  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4104  GCN5-related N-acetyltransferase  41.07 
 
 
170 aa  137  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0181775  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1420  GCN5-related N-acetyltransferase  40.65 
 
 
176 aa  137  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1455  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
172 aa  134  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0197  GCN5-related N-acetyltransferase  41.03 
 
 
182 aa  131  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000342044  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4893  tabtoxin resistance protein  40.38 
 
 
177 aa  124  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0582  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
177 aa  124  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2588  acetyltransferase  42.14 
 
 
167 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00776025  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3401  hypothetical protein  41.94 
 
 
177 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.737914  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2856  acetyltransferase  41.4 
 
 
167 aa  122  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.72924  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2839  acetyltransferase, GNAT family  41.4 
 
 
167 aa  122  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2454  acetyltransferase, GNAT family  42.58 
 
 
167 aa  122  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2877  acetyltransferase, GNAT family  41.94 
 
 
167 aa  121  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0106791  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4434  GCN5-related N-acetyltransferase  39.1 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189949  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2553  acetyltransferase  40.65 
 
 
167 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4523  GCN5-related N-acetyltransferase  41.46 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31037  normal  0.0470006 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2828  acetyltransferase  40 
 
 
167 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.738685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2834  acetyltransferase, GNAT family  40 
 
 
167 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000815753 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2637  acetyltransferase  40 
 
 
167 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.439574  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0329  GCN5-related N-acetyltransferase  40.13 
 
 
183 aa  118  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000416142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2629  GCN5-related N-acetyltransferase  41.29 
 
 
167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00815719  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3394  acetyltransferase  40.13 
 
 
194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.179299  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2012  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
175 aa  117  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.420393  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3472  GCN5-related N-acetyltransferase  38.64 
 
 
173 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0114  acetyltransferase protein  37.95 
 
 
174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0098  GCN5-related N-acetyltransferase  41.03 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1034  GCN5-related N-acetyltransferase  42.48 
 
 
183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1353  putative acetyltransferase protein  44.52 
 
 
175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0472783  hitchhiker  0.00977736 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3868  acetyltransferase  40.13 
 
 
181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052756  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2086  GCN5-related N-acetyltransferase  42.58 
 
 
179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477453  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1142  GCN5-related N-acetyltransferase  40.88 
 
 
153 aa  113  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.561673  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0092  GCN5-related N-acetyltransferase  39.74 
 
 
182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4258  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 
172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40130  hypothetical protein  39.35 
 
 
177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4179  GCN5-related N-acetyltransferase  37.18 
 
 
175 aa  111  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4801  GCN5-related N-acetyltransferase  40.38 
 
 
176 aa  111  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5268  GCN5-related N-acetyltransferase  43.87 
 
 
182 aa  111  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.90645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4479  GNAT family acetyltransferase  34.5 
 
 
175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.89727  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0191  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3138  acetyltransferase  39.74 
 
 
179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0894  acetyltransferase  39.74 
 
 
175 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3192  acetyltransferase  39.74 
 
 
426 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.722637  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2020  acetyltransferase  39.74 
 
 
175 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1882  acetyltransferase  39.74 
 
 
175 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3175  acetyltransferase  39.74 
 
 
175 aa  108  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2727  acetyltransferase  39.74 
 
 
175 aa  108  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6126  GCN5-related N-acetyltransferase  40.65 
 
 
196 aa  108  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350433  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1427  acetyltransferase  40.38 
 
 
175 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3322  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
176 aa  105  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.954498  normal  0.116948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4767  GCN5-related N-acetyltransferase  39.35 
 
 
173 aa  104  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0394  GCN5-related N-acetyltransferase  38.41 
 
 
198 aa  103  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.959695  normal  0.199216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5473  hypothetical protein  35.37 
 
 
174 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0372371 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4811  GCN5-related N-acetyltransferase  39.74 
 
 
176 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329045  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5403  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5458  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1865  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
175 aa  99.4  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00546663  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0126  GCN5-related N-acetyltransferase  39.1 
 
 
178 aa  89  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136967  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  27.16 
 
 
193 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.54285  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6174  hypothetical protein  26.88 
 
 
192 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8033  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
179 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1113  GCN5-related N-acetyltransferase  24.07 
 
 
180 aa  52.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614086  normal  0.911398 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1058  GCN5-related N-acetyltransferase  25.66 
 
 
193 aa  51.2  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6479  GCN5-related N-acetyltransferase  25.71 
 
 
185 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2418  GCN5-related N-acetyltransferase  32.71 
 
 
153 aa  47.4  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.05854  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2093  acetyltransferase  27.07 
 
 
176 aa  47  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0189  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4189  GCN5-related N-acetyltransferase  39.76 
 
 
173 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.218651  normal  0.0744564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1544  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.405729 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0029  GCN5-related N-acetyltransferase  25.48 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
150 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1885  acetyltransferase  29.2 
 
 
176 aa  45.4  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3052  putative acetyltransferase  32.22 
 
 
146 aa  45.4  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0013  acetyltransferase  29.2 
 
 
176 aa  45.4  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  40.86 
 
 
291 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  33.67 
 
 
150 aa  44.7  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06630  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  41.54 
 
 
155 aa  44.7  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300608  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5882  GCN5-related N-acetyltransferase  24.7 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2185  acetyltransferase  36.76 
 
 
83 aa  43.9  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0869  acetyltransferase  29.27 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00876898  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2400  GCN5-related protein N-acetyltransferase  33.02 
 
 
161 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.861634  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7268  GCN5-related N-acetyltransferase  23.87 
 
 
206 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.114808  normal  0.363594 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4157  GCN5-related N-acetyltransferase  30.93 
 
 
396 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4433  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
185 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1018  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 
151 aa  42.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.152337  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1887  GCN5-related N-acetyltransferase  28.7 
 
 
215 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000340804 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0003  GCN5-related N-acetyltransferase  28.68 
 
 
320 aa  42  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0856  acetyltransferase  28.46 
 
 
147 aa  42.4  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.739267  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1991  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 
157 aa  42  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.213352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2424  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.47 
 
 
148 aa  41.6  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2134  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  22.76 
 
 
148 aa  41.2  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3076  GCN5-related N-acetyltransferase  40.28 
 
 
159 aa  41.2  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04790  Predicted acetyltransferase  31.18 
 
 
152 aa  40.8  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>