179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3472 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_3472  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
173 aa  352  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4258  GCN5-related N-acetyltransferase  63.31 
 
 
172 aa  224  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4523  GCN5-related N-acetyltransferase  64.29 
 
 
172 aa  224  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31037  normal  0.0470006 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0114  acetyltransferase protein  62.5 
 
 
174 aa  224  6e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3401  hypothetical protein  56.07 
 
 
177 aa  193  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.737914  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4179  GCN5-related N-acetyltransferase  55.62 
 
 
175 aa  187  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0092  GCN5-related N-acetyltransferase  56.8 
 
 
182 aa  185  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1427  acetyltransferase  56.14 
 
 
175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40130  hypothetical protein  53.76 
 
 
177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0394  GCN5-related N-acetyltransferase  58.55 
 
 
198 aa  177  5.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.959695  normal  0.199216 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0191  GCN5-related N-acetyltransferase  55.56 
 
 
176 aa  177  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0098  GCN5-related N-acetyltransferase  55.03 
 
 
182 aa  176  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2012  GCN5-related N-acetyltransferase  50.29 
 
 
175 aa  176  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.420393  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3175  acetyltransferase  54.39 
 
 
175 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2020  acetyltransferase  54.39 
 
 
175 aa  175  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0894  acetyltransferase  54.39 
 
 
175 aa  175  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2727  acetyltransferase  54.39 
 
 
175 aa  175  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1882  acetyltransferase  54.39 
 
 
175 aa  175  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3192  acetyltransferase  54.39 
 
 
426 aa  174  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.722637  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4801  GCN5-related N-acetyltransferase  54.97 
 
 
176 aa  174  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3322  GCN5-related N-acetyltransferase  55.56 
 
 
176 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.954498  normal  0.116948 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5403  GCN5-related N-acetyltransferase  56.73 
 
 
176 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5458  GCN5-related N-acetyltransferase  56.73 
 
 
176 aa  169  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4811  GCN5-related N-acetyltransferase  56.73 
 
 
176 aa  169  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329045  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3138  acetyltransferase  53.14 
 
 
179 aa  168  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1034  GCN5-related N-acetyltransferase  53.16 
 
 
183 aa  163  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1865  GCN5-related N-acetyltransferase  48 
 
 
175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00546663  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4767  GCN5-related N-acetyltransferase  52.02 
 
 
173 aa  161  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0126  GCN5-related N-acetyltransferase  52.91 
 
 
178 aa  154  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136967  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2086  GCN5-related N-acetyltransferase  50.63 
 
 
179 aa  151  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477453  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1455  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 
172 aa  136  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0197  GCN5-related N-acetyltransferase  42.59 
 
 
182 aa  128  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000342044  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1656  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
175 aa  125  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3861  GCN5-related N-acetyltransferase  41.83 
 
 
173 aa  124  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1066  GCN5-related N-acetyltransferase  39.39 
 
 
168 aa  124  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.172049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4479  GNAT family acetyltransferase  39.18 
 
 
175 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.89727  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3293  GCN5-related N-acetyltransferase  41.77 
 
 
170 aa  122  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00428954  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5268  GCN5-related N-acetyltransferase  42.44 
 
 
182 aa  121  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.90645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5473  hypothetical protein  42.86 
 
 
174 aa  121  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0372371 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1353  putative acetyltransferase protein  41.71 
 
 
175 aa  121  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0472783  hitchhiker  0.00977736 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2553  acetyltransferase  35.95 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4434  GCN5-related N-acetyltransferase  38.15 
 
 
177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189949  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4104  GCN5-related N-acetyltransferase  40.51 
 
 
170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0181775  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2637  acetyltransferase  35.29 
 
 
167 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.439574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2828  acetyltransferase  35.29 
 
 
167 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.738685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2834  acetyltransferase, GNAT family  35.29 
 
 
167 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000815753 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2839  acetyltransferase, GNAT family  35.26 
 
 
167 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3927  acetyltransferase  38.64 
 
 
176 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2856  acetyltransferase  35.9 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.72924  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2877  acetyltransferase, GNAT family  35.26 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0106791  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2454  acetyltransferase, GNAT family  35.71 
 
 
167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4893  tabtoxin resistance protein  37.57 
 
 
177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6126  GCN5-related N-acetyltransferase  43.64 
 
 
196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350433  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1142  GCN5-related N-acetyltransferase  43.14 
 
 
153 aa  114  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.561673  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2629  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00815719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2588  acetyltransferase  35.95 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00776025  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0582  GCN5-related N-acetyltransferase  37.57 
 
 
177 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0329  GCN5-related N-acetyltransferase  37.01 
 
 
183 aa  101  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000416142  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3394  acetyltransferase  37.01 
 
 
194 aa  100  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.179299  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3868  acetyltransferase  37.01 
 
 
181 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052756  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1420  GCN5-related N-acetyltransferase  33.76 
 
 
176 aa  95.5  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6174  hypothetical protein  27.45 
 
 
192 aa  61.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2000  hypothetical protein  27.94 
 
 
201 aa  57.8  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1415  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
186 aa  57  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8033  GCN5-related N-acetyltransferase  31.17 
 
 
179 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0647  acetyltransferase  29.19 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0709  acetyltransferase, GNAT family  29.19 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0552  acetyltransferase  29.19 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0494  acetyltransferase  29.19 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.226849  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0496  acetyltransferase  29.19 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0621  acetyltransferase, GNAT family  29.19 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0583  acetyltransferase  29.19 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4718  acetyltransferase, GNAT family  29.19 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.33 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0639  acetyltransferase, GNAT family  29.19 
 
 
170 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0289  GCN5-related N-acetyltransferase  35.24 
 
 
171 aa  53.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000757903 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0501  GCN5-related N-acetyltransferase  29.19 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0284  GCN5-related N-acetyltransferase  35.24 
 
 
171 aa  53.1  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00100588  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1058  GCN5-related N-acetyltransferase  29.69 
 
 
193 aa  52  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0497  GCN5-related N-acetyltransferase  29.19 
 
 
170 aa  52  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0971  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
291 aa  52  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0499  acetyltransferase  30.06 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000971374  normal  0.678083 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2185  acetyltransferase  33.33 
 
 
83 aa  51.6  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0653  acetyltransferase  29.45 
 
 
168 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0714  acetyltransferase, GNAT family  29.45 
 
 
168 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0555  acetyltransferase  29.45 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0497  acetyltransferase, GNAT  29.45 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0643  acetyltransferase, GNAT family  29.45 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0587  acetyltransferase  29.45 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4712  acetyltransferase, GNAT family  29.45 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0953  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2711  GCN5-related N-acetyltransferase  37.61 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0625  acetyltransferase, GNAT family  29.45 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2718  transcriptional regulator  55.93 
 
 
290 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1094  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3386  GCN5-related N-acetyltransferase  36.71 
 
 
139 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0349  GCN5-related N-acetyltransferase  36.19 
 
 
189 aa  49.3  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000326393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1244  GCN5-related N-acetyltransferase  34.02 
 
 
177 aa  48.9  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0357643  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0500  GCN5-related N-acetyltransferase  30.41 
 
 
168 aa  48.5  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>