128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3293 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3293  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
170 aa  339  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00428954  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4104  GCN5-related N-acetyltransferase  94.12 
 
 
170 aa  318  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0181775  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1066  GCN5-related N-acetyltransferase  45.29 
 
 
168 aa  149  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.172049  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1656  GCN5-related N-acetyltransferase  47.02 
 
 
175 aa  150  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2856  acetyltransferase  45.1 
 
 
167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.72924  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0197  GCN5-related N-acetyltransferase  45.29 
 
 
182 aa  143  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000342044  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0114  acetyltransferase protein  42.17 
 
 
174 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2637  acetyltransferase  45.45 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.439574  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2553  acetyltransferase  45.1 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2828  acetyltransferase  45.45 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.738685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2834  acetyltransferase, GNAT family  45.45 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000815753 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3927  acetyltransferase  41.67 
 
 
176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2588  acetyltransferase  43.14 
 
 
167 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00776025  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2877  acetyltransferase, GNAT family  43.79 
 
 
167 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0106791  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2839  acetyltransferase, GNAT family  44.37 
 
 
167 aa  137  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0582  GCN5-related N-acetyltransferase  42.26 
 
 
177 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2454  acetyltransferase, GNAT family  44.44 
 
 
167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2629  GCN5-related N-acetyltransferase  43.14 
 
 
167 aa  134  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00815719  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1455  GCN5-related N-acetyltransferase  42.01 
 
 
172 aa  130  6.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3401  hypothetical protein  44.44 
 
 
177 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.737914  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0329  GCN5-related N-acetyltransferase  42.44 
 
 
183 aa  124  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000416142  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4258  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
172 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3394  acetyltransferase  40.35 
 
 
194 aa  123  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.179299  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4523  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
172 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31037  normal  0.0470006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3472  GCN5-related N-acetyltransferase  41.77 
 
 
173 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3868  acetyltransferase  42.44 
 
 
181 aa  121  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052756  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4179  GCN5-related N-acetyltransferase  43.87 
 
 
175 aa  121  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0098  GCN5-related N-acetyltransferase  41.86 
 
 
182 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1420  GCN5-related N-acetyltransferase  41.06 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0092  GCN5-related N-acetyltransferase  40.35 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5268  GCN5-related N-acetyltransferase  46.79 
 
 
182 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.90645 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0394  GCN5-related N-acetyltransferase  43.05 
 
 
198 aa  118  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.959695  normal  0.199216 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4434  GCN5-related N-acetyltransferase  38.69 
 
 
177 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189949  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40130  hypothetical protein  42.48 
 
 
177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4893  tabtoxin resistance protein  38.1 
 
 
177 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2012  GCN5-related N-acetyltransferase  38.96 
 
 
175 aa  114  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.420393  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3861  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
173 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1353  putative acetyltransferase protein  47.18 
 
 
175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0472783  hitchhiker  0.00977736 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6126  GCN5-related N-acetyltransferase  44.52 
 
 
196 aa  113  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350433  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4801  GCN5-related N-acetyltransferase  39.18 
 
 
176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5473  hypothetical protein  42.01 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0372371 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1865  GCN5-related N-acetyltransferase  38.37 
 
 
175 aa  110  8.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00546663  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2086  GCN5-related N-acetyltransferase  41.83 
 
 
179 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477453  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4479  GNAT family acetyltransferase  37.82 
 
 
175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.89727  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1142  GCN5-related N-acetyltransferase  43.14 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.561673  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0191  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
176 aa  107  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1034  GCN5-related N-acetyltransferase  40.52 
 
 
183 aa  107  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5403  GCN5-related N-acetyltransferase  38.01 
 
 
176 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5458  GCN5-related N-acetyltransferase  38.01 
 
 
176 aa  104  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4811  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
176 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329045  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3322  GCN5-related N-acetyltransferase  37.43 
 
 
176 aa  101  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.954498  normal  0.116948 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3138  acetyltransferase  39.02 
 
 
179 aa  99  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4767  GCN5-related N-acetyltransferase  43.14 
 
 
173 aa  97.8  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3175  acetyltransferase  37.87 
 
 
175 aa  97.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2020  acetyltransferase  37.87 
 
 
175 aa  97.4  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0894  acetyltransferase  37.87 
 
 
175 aa  97.4  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2727  acetyltransferase  37.87 
 
 
175 aa  97.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1882  acetyltransferase  37.87 
 
 
175 aa  97.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3192  acetyltransferase  39.61 
 
 
426 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.722637  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1427  acetyltransferase  40.13 
 
 
175 aa  95.9  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0126  GCN5-related N-acetyltransferase  43.51 
 
 
178 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136967  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1058  GCN5-related N-acetyltransferase  29.32 
 
 
193 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6479  GCN5-related N-acetyltransferase  27.92 
 
 
185 aa  54.3  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1415  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
186 aa  54.3  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.175999  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3590  GCN5-related protein N-acetyltransferase  35.77 
 
 
322 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6174  hypothetical protein  27.01 
 
 
192 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1276  GCN5-related N-acetyltransferase  42.47 
 
 
155 aa  52  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.762819 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4166  GCN5-related N-acetyltransferase  43.24 
 
 
156 aa  50.8  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09200  acetyltransferase  38.75 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0795063  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2185  acetyltransferase  37.88 
 
 
83 aa  49.7  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1166  GCN5-related N-acetyltransferase  39.47 
 
 
155 aa  50.1  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.486231  unclonable  0.0000000237165 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7268  GCN5-related N-acetyltransferase  27.54 
 
 
206 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.114808  normal  0.363594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8064  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
169 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0384361  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8033  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 
179 aa  48.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3541  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
152 aa  47.8  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.499146 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3052  putative acetyltransferase  35.71 
 
 
146 aa  47.8  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1474  GCN5-related N-acetyltransferase  37.11 
 
 
156 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  33.68 
 
 
162 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570513  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2119  GCN5-related N-acetyltransferase  26.45 
 
 
148 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5807  hypothetical protein  46.15 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0396  GCN5-related N-acetyltransferase  27.56 
 
 
183 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.617467  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1073  GCN5-related N-acetyltransferase  35.9 
 
 
151 aa  45.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.687603  normal  0.368888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  30.7 
 
 
160 aa  44.7  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610284  normal  0.0661869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7297  GCN5-related N-acetyltransferase  37.78 
 
 
156 aa  44.3  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.537656 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0015  GCN5-related N-acetyltransferase  39.76 
 
 
153 aa  44.3  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  32.5 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2000  hypothetical protein  23.53 
 
 
201 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0450  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4903  GCN5-related N-acetyltransferase  23.91 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449893  hitchhiker  0.00644876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0953  GCN5-related N-acetyltransferase  31.69 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  29.08 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24460  acetyltransferase  34.07 
 
 
187 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5587  hypothetical protein  23.91 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4352  GCN5-related N-acetyltransferase  35.63 
 
 
183 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873897  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2006  GCN5-related N-acetyltransferase  29.59 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0135971  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0335  acetyltransferase  37.88 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.793507  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06700  acetyltransferase  29.14 
 
 
171 aa  42.4  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2854  metalloendopeptidase, glycoprotease family  33.65 
 
 
891 aa  42.4  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.594224  normal  0.241498 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0403  putative acetyltransferase  33.72 
 
 
175 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2841  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.55 
 
 
139 aa  42.4  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000949861  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>