52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2000 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2000  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  407  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6174  hypothetical protein  34.5 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7268  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.114808  normal  0.363594 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0197  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000342044  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1034  GCN5-related N-acetyltransferase  28.37 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3472  GCN5-related N-acetyltransferase  27.94 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1455  GCN5-related N-acetyltransferase  31.16 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0114  acetyltransferase protein  25.52 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1865  GCN5-related N-acetyltransferase  26.62 
 
 		 175 aa  52.4  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00546663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5473  hypothetical protein  27.94 
 
 		 174 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0372371 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2629  GCN5-related N-acetyltransferase  22.63 
 
 		 167 aa  51.6  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00815719  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2877  acetyltransferase, GNAT family  22.45 
 
 		 167 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0106791  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2553  acetyltransferase  23.7 
 
 		 167 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2588  acetyltransferase  24.44 
 
 		 167 aa  51.2  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00776025  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2828  acetyltransferase  23.7 
 
 		 167 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.738685  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1353  putative acetyltransferase protein  27.46 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0472783  hitchhiker  0.00977736 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2834  acetyltransferase, GNAT family  23.7 
 
 		 167 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000815753 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2637  acetyltransferase  23.7 
 
 		 167 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.439574  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5268  GCN5-related N-acetyltransferase  26.38 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.90645 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3401  hypothetical protein  28.26 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.737914  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1420  GCN5-related N-acetyltransferase  20.99 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2856  acetyltransferase  22.63 
 
 		 167 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.72924  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4479  GNAT family acetyltransferase  25.74 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.89727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2012  GCN5-related N-acetyltransferase  26.9 
 
 		 175 aa  48.9  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.420393  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4523  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 		 172 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31037  normal  0.0470006 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3322  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 		 176 aa  48.5  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.954498  normal  0.116948 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2839  acetyltransferase, GNAT family  21.9 
 
 		 167 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0653  acetyltransferase  24.14 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0555  acetyltransferase  24.14 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0497  acetyltransferase, GNAT  24.14 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0643  acetyltransferase, GNAT family  24.14 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2454  acetyltransferase, GNAT family  21.77 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0625  acetyltransferase, GNAT family  24.14 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0587  acetyltransferase  24.14 
 
 		 168 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0714  acetyltransferase, GNAT family  24.14 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0500  GCN5-related N-acetyltransferase  23.28 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4258  GCN5-related N-acetyltransferase  25.74 
 
 		 172 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4104  GCN5-related N-acetyltransferase  24.09 
 
 		 170 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0181775  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0329  GCN5-related N-acetyltransferase  23.4 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000416142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4712  acetyltransferase, GNAT family  24.14 
 
 		 168 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2086  GCN5-related N-acetyltransferase  26.53 
 
 		 179 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40130  hypothetical protein  26.09 
 
 		 177 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3394  acetyltransferase  23.4 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.179299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4801  GCN5-related N-acetyltransferase  27.74 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0582  GCN5-related N-acetyltransferase  24.29 
 
 		 177 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0394  GCN5-related N-acetyltransferase  26.02 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.959695  normal  0.199216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3293  GCN5-related N-acetyltransferase  23.53 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00428954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2006  GCN5-related N-acetyltransferase  22.55 
 
 		 166 aa  43.5  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0135971  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0191  GCN5-related N-acetyltransferase  26.28 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2680  acetyltransferase  28.4 
 
 		 166 aa  41.6  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000272485  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6126  GCN5-related N-acetyltransferase  27.94 
 
 		 196 aa  41.6  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2937  acetyltransferase, GNAT family  28.4 
 
 		 166 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.29735e-47 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>