116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4893 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4893  tabtoxin resistance protein  100 
 
 
177 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4434  GCN5-related N-acetyltransferase  91.53 
 
 
177 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189949  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0582  GCN5-related N-acetyltransferase  63.58 
 
 
177 aa  223  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0197  GCN5-related N-acetyltransferase  51.2 
 
 
182 aa  173  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000342044  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3394  acetyltransferase  50 
 
 
194 aa  171  5e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.179299  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0329  GCN5-related N-acetyltransferase  50.6 
 
 
183 aa  170  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000416142  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3868  acetyltransferase  50.6 
 
 
181 aa  166  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052756  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3401  hypothetical protein  42.77 
 
 
177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.737914  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3927  acetyltransferase  40.38 
 
 
176 aa  124  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0114  acetyltransferase protein  42.21 
 
 
174 aa  124  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2856  acetyltransferase  39.87 
 
 
167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.72924  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40130  hypothetical protein  39.31 
 
 
177 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2839  acetyltransferase, GNAT family  39.87 
 
 
167 aa  117  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2629  GCN5-related N-acetyltransferase  39.87 
 
 
167 aa  117  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00815719  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3861  GCN5-related N-acetyltransferase  39.74 
 
 
173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2454  acetyltransferase, GNAT family  39.22 
 
 
167 aa  115  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4523  GCN5-related N-acetyltransferase  41.76 
 
 
172 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31037  normal  0.0470006 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2553  acetyltransferase  39.22 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3472  GCN5-related N-acetyltransferase  37.57 
 
 
173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3293  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
170 aa  114  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00428954  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4104  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
170 aa  114  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0181775  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2877  acetyltransferase, GNAT family  38.56 
 
 
167 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0106791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2637  acetyltransferase  38.56 
 
 
167 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.439574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2828  acetyltransferase  38.56 
 
 
167 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.738685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2834  acetyltransferase, GNAT family  38.56 
 
 
167 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000815753 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1066  GCN5-related N-acetyltransferase  38.15 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.172049  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2588  acetyltransferase  39.22 
 
 
167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00776025  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1455  GCN5-related N-acetyltransferase  41.4 
 
 
172 aa  110  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5473  hypothetical protein  38.73 
 
 
174 aa  110  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0372371 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4258  GCN5-related N-acetyltransferase  38.1 
 
 
172 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6126  GCN5-related N-acetyltransferase  43.14 
 
 
196 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350433  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1656  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
175 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5268  GCN5-related N-acetyltransferase  37.35 
 
 
182 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.90645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1353  putative acetyltransferase protein  39.35 
 
 
175 aa  97.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0472783  hitchhiker  0.00977736 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4767  GCN5-related N-acetyltransferase  37.57 
 
 
173 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.464247 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1865  GCN5-related N-acetyltransferase  38.29 
 
 
175 aa  96.7  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00546663  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4179  GCN5-related N-acetyltransferase  36.26 
 
 
175 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0092  GCN5-related N-acetyltransferase  34.88 
 
 
182 aa  94.4  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1142  GCN5-related N-acetyltransferase  39.47 
 
 
153 aa  94  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.561673  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0098  GCN5-related N-acetyltransferase  35.88 
 
 
182 aa  93.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1420  GCN5-related N-acetyltransferase  29.76 
 
 
176 aa  93.2  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1034  GCN5-related N-acetyltransferase  36.69 
 
 
183 aa  93.2  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2012  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
175 aa  88.2  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.420393  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0394  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
198 aa  87.8  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.959695  normal  0.199216 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2086  GCN5-related N-acetyltransferase  35.88 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477453  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4801  GCN5-related N-acetyltransferase  34.12 
 
 
176 aa  85.1  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3175  acetyltransferase  34.09 
 
 
175 aa  84.3  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2020  acetyltransferase  34.09 
 
 
175 aa  84  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0894  acetyltransferase  34.09 
 
 
175 aa  84  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2727  acetyltransferase  34.09 
 
 
175 aa  84  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1882  acetyltransferase  34.09 
 
 
175 aa  84  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3192  acetyltransferase  34.09 
 
 
426 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.722637  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3322  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.954498  normal  0.116948 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0191  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3138  acetyltransferase  33.33 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1427  acetyltransferase  34.84 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4479  GNAT family acetyltransferase  32.47 
 
 
175 aa  77  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.89727  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0126  GCN5-related N-acetyltransferase  35.06 
 
 
178 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.136967  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5403  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5458  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4811  GCN5-related N-acetyltransferase  32.94 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329045  normal  0.841881 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1058  GCN5-related N-acetyltransferase  34.31 
 
 
193 aa  60.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1094  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2501  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  44.62 
 
 
289 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6479  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 
185 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  27.94 
 
 
193 aa  48.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.54285  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2975  acetyltransferase  27.39 
 
 
164 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0869  acetyltransferase  35 
 
 
147 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00876898  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0856  acetyltransferase  35 
 
 
147 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.739267  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1034  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.16 
 
 
371 aa  45.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0953  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 
176 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0877  acetyltransferase  28.47 
 
 
169 aa  45.1  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1428  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
170 aa  44.7  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4189  GCN5-related N-acetyltransferase  34.15 
 
 
173 aa  44.7  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.218651  normal  0.0744564 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3386  GCN5-related N-acetyltransferase  39.34 
 
 
139 aa  44.7  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1745  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
291 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550965  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0798  GCN5-related N-acetyltransferase  35.82 
 
 
143 aa  44.7  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3070  acetyltransferase, GNAT family  36.92 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  34.07 
 
 
382 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.085946  normal  0.936747 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2711  GCN5-related N-acetyltransferase  36.23 
 
 
170 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.695476  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09200  acetyltransferase  33.33 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0795063  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0029  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 
189 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1113  GCN5-related N-acetyltransferase  25.74 
 
 
180 aa  43.9  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614086  normal  0.911398 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06630  acetyltransferase, N-acetylglutamate synthase  35.8 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300608  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3281  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 
137 aa  43.9  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.229217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8064  GCN5-related N-acetyltransferase  28.3 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0384361  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2489  acetyltransferase  39.71 
 
 
141 aa  43.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221724  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3401  GCN5-related N-acetyltransferase  35.96 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.5 
 
 
291 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3309  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
150 aa  43.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2151  acetyltransferase  35.62 
 
 
166 aa  42.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4166  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2064  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.62 
 
 
166 aa  42.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.224111  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2185  acetyltransferase  36.36 
 
 
83 aa  42.4  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2226  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  40 
 
 
291 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326568  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0544  GCN5-related N-acetyltransferase  34.12 
 
 
146 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3289  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 
170 aa  42  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
144 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0878  GCN5-related N-acetyltransferase  34.94 
 
 
149 aa  42  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2239  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
159 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>