24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0856 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0856  acetyltransferase  100 
 
 		 147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.739267  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0869  acetyltransferase  98.64 
 
 		 147 aa  297  3e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00876898  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1822  GCN5-related N-acetyltransferase  27.86 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1760  GCN5-related N-acetyltransferase  27.86 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000079668  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1539  GCN5-related N-acetyltransferase  28.87 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1820  acetyltransferase  26.32 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6394  GCN5-related N-acetyltransferase  26.76 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.423137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2274  GCN5-related N-acetyltransferase  32.41 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0329  GCN5-related N-acetyltransferase  39.34 
 
 		 183 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000416142  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05434  acetyltransferase  31.53 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3394  acetyltransferase  39.34 
 
 		 194 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.179299  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4893  tabtoxin resistance protein  35 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0197  GCN5-related N-acetyltransferase  32.18 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000342044  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4434  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 		 177 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.189949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1314  GCN5-related N-acetyltransferase  28.37 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0222  GCN5-related protein N-acetyltransferase  25.53 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3927  acetyltransferase  28.46 
 
 		 176 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0582  GCN5-related N-acetyltransferase  30.68 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2717  acetyltransferase  33.98 
 
 		 145 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35760  hypothetical protein  27.54 
 
 		 154 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  9.28006e-16  decreased coverage  1.5308899999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3868  acetyltransferase  42.31 
 
 		 181 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052756  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2597  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.32 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28630  acetyltransferase  25.34 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319121  normal  0.0687549 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1831  GCN5-related N-acetyltransferase  30.86 
 
 		 158 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0803543  normal  0.0847083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>