36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2278 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_2185  hypothetical protein  96.35 
 
 		 510 aa  950    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2278  hypothetical protein  100 
 
 		 494 aa  989    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0048  hypothetical protein  64.01 
 
 		 484 aa  605  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0017  hypothetical protein  60.12 
 
 		 484 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1811  hypothetical protein  57.46 
 
 		 481 aa  559  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0518  hypothetical protein  57.26 
 
 		 482 aa  552  1e-156  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.566512  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0737  hypothetical protein  55.78 
 
 		 482 aa  543  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.509556  normal  0.0133056 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0838  hypothetical protein  57.26 
 
 		 480 aa  534  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0222  hypothetical protein  55.49 
 
 		 488 aa  528  1e-149  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00993068 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1446  hypothetical protein  56.03 
 
 		 482 aa  527  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0901  hypothetical protein  56.3 
 
 		 483 aa  524  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0797032  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0780  hypothetical protein  55.83 
 
 		 481 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2296  hypothetical protein  49.28 
 
 		 478 aa  466  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.357562  normal  0.109764 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03600  hypothetical protein  47.38 
 
 		 510 aa  442  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1630  hypothetical protein  47.26 
 
 		 486 aa  434  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0742  hypothetical protein  56.36 
 
 		 412 aa  394  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1131  hypothetical protein  47.26 
 
 		 489 aa  383  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4005  hypothetical protein  32.25 
 
 		 489 aa  192  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0110668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03537  hypothetical protein  31.19 
 
 		 490 aa  179  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3164  hypothetical protein  28.54 
 
 		 487 aa  157  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0627  hypothetical protein  44.89 
 
 		 176 aa  151  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1123  hypothetical protein  25.54 
 
 		 488 aa  143  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.963285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0870  hypothetical protein  26.94 
 
 		 490 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26590  hypothetical protein  28.6 
 
 		 515 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03250  hypothetical protein  28.45 
 
 		 538 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127047  unclonable  2.10051e-21 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22890  Methyl-accepting chemotaxis protein  26.98 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3698  hypothetical protein  27.41 
 
 		 499 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268851  decreased coverage  0.000278839 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49830  hypothetical protein  27.73 
 
 		 450 aa  90.1  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0065  hypothetical protein  22.27 
 
 		 492 aa  77.8  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.950662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3740  hypothetical protein  24.94 
 
 		 485 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0271  hypothetical protein  25.08 
 
 		 507 aa  58.9  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  decreased coverage  0.00169568 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2029  hypothetical protein  24.92 
 
 		 490 aa  56.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3942  hypothetical protein  22.81 
 
 		 482 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1567  hypothetical protein  22.07 
 
 		 522 aa  47.8  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2222  hypothetical protein  23.55 
 
 		 499 aa  47  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17220  hypothetical protein  24.26 
 
 		 477 aa  46.6  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.96015  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>