39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03600 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_03600  hypothetical protein  100 
 
 
510 aa  1017    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1630  hypothetical protein  59.83 
 
 
486 aa  563  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1811  hypothetical protein  51.35 
 
 
481 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0017  hypothetical protein  52.58 
 
 
484 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0737  hypothetical protein  48.44 
 
 
482 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.509556  normal  0.0133056 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0048  hypothetical protein  51.13 
 
 
484 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2185  hypothetical protein  47.18 
 
 
510 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0222  hypothetical protein  50.31 
 
 
488 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00993068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1131  hypothetical protein  52.6 
 
 
489 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0518  hypothetical protein  48.55 
 
 
482 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.566512  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2278  hypothetical protein  47.38 
 
 
494 aa  442  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1446  hypothetical protein  50.21 
 
 
482 aa  437  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0838  hypothetical protein  48.86 
 
 
480 aa  436  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0780  hypothetical protein  49.9 
 
 
481 aa  437  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0901  hypothetical protein  49.69 
 
 
483 aa  432  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0797032  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2296  hypothetical protein  48.65 
 
 
478 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.357562  normal  0.109764 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0742  hypothetical protein  56.07 
 
 
412 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03537  hypothetical protein  31.3 
 
 
490 aa  183  8.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4005  hypothetical protein  31.12 
 
 
489 aa  182  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0110668 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1123  hypothetical protein  29.03 
 
 
488 aa  169  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.963285 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0627  hypothetical protein  48.28 
 
 
176 aa  164  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3164  hypothetical protein  28.13 
 
 
487 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26590  hypothetical protein  28.88 
 
 
515 aa  139  7.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0870  hypothetical protein  25.98 
 
 
490 aa  120  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282403  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22890  Methyl-accepting chemotaxis protein  27.98 
 
 
487 aa  105  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0065  hypothetical protein  24.06 
 
 
492 aa  101  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.950662  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3698  hypothetical protein  30.61 
 
 
499 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268851  decreased coverage  0.000278839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03250  hypothetical protein  27.2 
 
 
538 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127047  unclonable  2.10051e-21 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49830  hypothetical protein  29.21 
 
 
450 aa  87.4  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0271  hypothetical protein  28.75 
 
 
507 aa  58.9  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  decreased coverage  0.00169568 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3740  hypothetical protein  23.74 
 
 
485 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5157  hypothetical protein  24.1 
 
 
496 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265097  normal  0.0750185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3942  hypothetical protein  24.23 
 
 
482 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2066  hypothetical protein  25.68 
 
 
502 aa  51.2  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0285936  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0865  hypothetical protein  25.64 
 
 
480 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0882  hypothetical protein  25.64 
 
 
480 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104692  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0871  hypothetical protein  25.64 
 
 
480 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566977  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2222  hypothetical protein  24.91 
 
 
499 aa  45.4  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1174  hypothetical protein  25.59 
 
 
485 aa  43.5  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.180277  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>