43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03537 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_4005  hypothetical protein  80.37 
 
 		 489 aa  770    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0110668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03537  hypothetical protein  100 
 
 		 490 aa  957    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3164  hypothetical protein  52.2 
 
 		 487 aa  462  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0870  hypothetical protein  43.84 
 
 		 490 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26590  hypothetical protein  35.31 
 
 		 515 aa  261  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22890  Methyl-accepting chemotaxis protein  38.06 
 
 		 487 aa  257  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0065  hypothetical protein  30.06 
 
 		 492 aa  199  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.950662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2296  hypothetical protein  32.22 
 
 		 478 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.357562  normal  0.109764 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1811  hypothetical protein  31.62 
 
 		 481 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03600  hypothetical protein  31.3 
 
 		 510 aa  183  8.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0838  hypothetical protein  30.26 
 
 		 480 aa  182  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0737  hypothetical protein  29.56 
 
 		 482 aa  182  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.509556  normal  0.0133056 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1446  hypothetical protein  30.79 
 
 		 482 aa  179  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2278  hypothetical protein  31.19 
 
 		 494 aa  179  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2185  hypothetical protein  31 
 
 		 510 aa  173  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0780  hypothetical protein  30.23 
 
 		 481 aa  169  8e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0518  hypothetical protein  28.45 
 
 		 482 aa  169  9e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.566512  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0901  hypothetical protein  29.54 
 
 		 483 aa  169  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0797032  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0048  hypothetical protein  31.93 
 
 		 484 aa  167  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0222  hypothetical protein  29.11 
 
 		 488 aa  166  5.9999999999999996e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00993068 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0742  hypothetical protein  33.73 
 
 		 412 aa  160  5e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0017  hypothetical protein  29.55 
 
 		 484 aa  159  9e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1630  hypothetical protein  29.5 
 
 		 486 aa  157  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1131  hypothetical protein  31.08 
 
 		 489 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03250  hypothetical protein  32.23 
 
 		 538 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127047  unclonable  2.10051e-21 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3740  hypothetical protein  26.53 
 
 		 485 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3942  hypothetical protein  27.93 
 
 		 482 aa  117  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49830  hypothetical protein  32.31 
 
 		 450 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3698  hypothetical protein  28.82 
 
 		 499 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268851  decreased coverage  0.000278839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1123  hypothetical protein  23.4 
 
 		 488 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.963285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2066  hypothetical protein  25.12 
 
 		 502 aa  85.1  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0285936  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2222  hypothetical protein  27.71 
 
 		 499 aa  84  0.000000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2029  hypothetical protein  29 
 
 		 490 aa  76.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17220  hypothetical protein  27.13 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.96015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0627  hypothetical protein  33.58 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0271  hypothetical protein  25.23 
 
 		 507 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  decreased coverage  0.00169568 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1567  hypothetical protein  23.19 
 
 		 522 aa  64.7  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2511  hypothetical protein  25.49 
 
 		 511 aa  62.4  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.398866  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5157  hypothetical protein  24.03 
 
 		 496 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265097  normal  0.0750185 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0865  hypothetical protein  25.82 
 
 		 480 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0882  hypothetical protein  25.82 
 
 		 480 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0871  hypothetical protein  23.93 
 
 		 480 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1174  hypothetical protein  23.32 
 
 		 485 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>