36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_49830 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_03250  hypothetical protein  95.56 
 
 
538 aa  848    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127047  unclonable  2.10051e-21 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49830  hypothetical protein  100 
 
 
450 aa  890    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3698  hypothetical protein  63.33 
 
 
499 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268851  decreased coverage  0.000278839 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03537  hypothetical protein  32.31 
 
 
490 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4005  hypothetical protein  33.08 
 
 
489 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0110668 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0518  hypothetical protein  25.07 
 
 
482 aa  95.9  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.566512  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2185  hypothetical protein  28.15 
 
 
510 aa  93.2  8e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0737  hypothetical protein  23.94 
 
 
482 aa  91.7  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.509556  normal  0.0133056 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2278  hypothetical protein  27.73 
 
 
494 aa  90.1  8e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3164  hypothetical protein  24.32 
 
 
487 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03600  hypothetical protein  29.21 
 
 
510 aa  87.4  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3740  hypothetical protein  30.77 
 
 
485 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1630  hypothetical protein  27.72 
 
 
486 aa  83.6  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0901  hypothetical protein  25.64 
 
 
483 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0797032  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0838  hypothetical protein  26.78 
 
 
480 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0017  hypothetical protein  28.49 
 
 
484 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26590  hypothetical protein  26.72 
 
 
515 aa  77.4  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1446  hypothetical protein  29.25 
 
 
482 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0048  hypothetical protein  25.08 
 
 
484 aa  77  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0742  hypothetical protein  30.61 
 
 
412 aa  76.3  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3942  hypothetical protein  29.11 
 
 
482 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0780  hypothetical protein  24.61 
 
 
481 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1811  hypothetical protein  24.19 
 
 
481 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2296  hypothetical protein  29.25 
 
 
478 aa  74.7  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.357562  normal  0.109764 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22890  Methyl-accepting chemotaxis protein  27.08 
 
 
487 aa  73.9  0.000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1131  hypothetical protein  37.5 
 
 
489 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0222  hypothetical protein  29.94 
 
 
488 aa  67  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00993068 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0870  hypothetical protein  25.71 
 
 
490 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282403  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2066  hypothetical protein  25 
 
 
502 aa  61.6  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0285936  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17220  hypothetical protein  29.86 
 
 
477 aa  60.5  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.96015  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1567  hypothetical protein  24.36 
 
 
522 aa  59.7  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2222  hypothetical protein  30.1 
 
 
499 aa  59.7  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0065  hypothetical protein  22.75 
 
 
492 aa  50.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.950662  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1123  hypothetical protein  24.16 
 
 
488 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.963285 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2029  hypothetical protein  25.69 
 
 
490 aa  47.4  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0627  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>