31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_17220 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_17220  hypothetical protein  100 
 
 
477 aa  940    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.96015  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2029  hypothetical protein  67.03 
 
 
490 aa  553  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2222  hypothetical protein  57.6 
 
 
499 aa  478  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1567  hypothetical protein  35.1 
 
 
522 aa  266  5e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0271  hypothetical protein  34.83 
 
 
507 aa  215  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  decreased coverage  0.00169568 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3740  hypothetical protein  28.06 
 
 
485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3942  hypothetical protein  27.27 
 
 
482 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22890  Methyl-accepting chemotaxis protein  29.41 
 
 
487 aa  102  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3164  hypothetical protein  27.53 
 
 
487 aa  98.6  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0870  hypothetical protein  27.86 
 
 
490 aa  94.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282403  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0065  hypothetical protein  26.09 
 
 
492 aa  92  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.950662  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4005  hypothetical protein  27.51 
 
 
489 aa  89  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0110668 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26590  hypothetical protein  25.79 
 
 
515 aa  76.6  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03537  hypothetical protein  27.13 
 
 
490 aa  75.5  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03250  hypothetical protein  28.09 
 
 
538 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127047  unclonable  2.10051e-21 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3698  hypothetical protein  25.6 
 
 
499 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268851  decreased coverage  0.000278839 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0017  hypothetical protein  28.45 
 
 
484 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49830  hypothetical protein  29.86 
 
 
450 aa  60.5  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0737  hypothetical protein  26.27 
 
 
482 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.509556  normal  0.0133056 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1446  hypothetical protein  27.39 
 
 
482 aa  55.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0838  hypothetical protein  29.56 
 
 
480 aa  53.5  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0901  hypothetical protein  30.1 
 
 
483 aa  53.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0797032  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0780  hypothetical protein  28.28 
 
 
481 aa  51.2  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0518  hypothetical protein  26.86 
 
 
482 aa  50.4  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.566512  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2066  hypothetical protein  25.9 
 
 
502 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0285936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1811  hypothetical protein  26.36 
 
 
481 aa  48.5  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0048  hypothetical protein  26.97 
 
 
484 aa  47  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2185  hypothetical protein  24.27 
 
 
510 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2278  hypothetical protein  24.26 
 
 
494 aa  46.6  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0422  hypothetical protein  23.09 
 
 
543 aa  45.8  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0372784  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1123  hypothetical protein  26.01 
 
 
488 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.963285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>