35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3698 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3698  hypothetical protein  100 
 
 		 499 aa  999    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268851  decreased coverage  0.000278839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03250  hypothetical protein  61.92 
 
 		 538 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127047  unclonable  2.10051e-21 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49830  hypothetical protein  63.33 
 
 		 450 aa  574  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2185  hypothetical protein  27.84 
 
 		 510 aa  106  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4005  hypothetical protein  28.99 
 
 		 489 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0110668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03537  hypothetical protein  28.82 
 
 		 490 aa  104  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0518  hypothetical protein  25.81 
 
 		 482 aa  103  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.566512  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2278  hypothetical protein  27.41 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3164  hypothetical protein  24.95 
 
 		 487 aa  94.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0737  hypothetical protein  26.51 
 
 		 482 aa  94  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.509556  normal  0.0133056 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0742  hypothetical protein  28.46 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03600  hypothetical protein  30.61 
 
 		 510 aa  91.7  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1446  hypothetical protein  28.52 
 
 		 482 aa  90.1  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0780  hypothetical protein  30.47 
 
 		 481 aa  89.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0838  hypothetical protein  29.07 
 
 		 480 aa  89.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1131  hypothetical protein  30.77 
 
 		 489 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0017  hypothetical protein  28.8 
 
 		 484 aa  87.4  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0901  hypothetical protein  28.12 
 
 		 483 aa  87  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0797032  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1811  hypothetical protein  24.2 
 
 		 481 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3740  hypothetical protein  24.71 
 
 		 485 aa  85.1  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0222  hypothetical protein  28.46 
 
 		 488 aa  84.7  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00993068 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0048  hypothetical protein  26.87 
 
 		 484 aa  84  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1630  hypothetical protein  28.29 
 
 		 486 aa  83.2  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26590  hypothetical protein  23.06 
 
 		 515 aa  81.3  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2296  hypothetical protein  25.88 
 
 		 478 aa  80.5  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.357562  normal  0.109764 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3942  hypothetical protein  24.64 
 
 		 482 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0870  hypothetical protein  24.38 
 
 		 490 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2222  hypothetical protein  28.79 
 
 		 499 aa  68.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22890  Methyl-accepting chemotaxis protein  26.09 
 
 		 487 aa  63.2  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17220  hypothetical protein  25.6 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.96015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2066  hypothetical protein  25 
 
 		 502 aa  61.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0285936  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1567  hypothetical protein  25.16 
 
 		 522 aa  60.8  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1123  hypothetical protein  20.61 
 
 		 488 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.963285 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2029  hypothetical protein  25.32 
 
 		 490 aa  54.7  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0065  hypothetical protein  20.91 
 
 		 492 aa  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.950662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>