38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3164 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3164  hypothetical protein  100 
 
 
487 aa  971    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03537  hypothetical protein  52.2 
 
 
490 aa  479  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4005  hypothetical protein  49.58 
 
 
489 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0110668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0870  hypothetical protein  47.17 
 
 
490 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282403  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26590  hypothetical protein  36.29 
 
 
515 aa  259  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22890  Methyl-accepting chemotaxis protein  37.17 
 
 
487 aa  257  4e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0065  hypothetical protein  29.35 
 
 
492 aa  223  8e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.950662  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1811  hypothetical protein  29.83 
 
 
481 aa  184  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0901  hypothetical protein  29.57 
 
 
483 aa  176  7e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0797032  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2296  hypothetical protein  28.36 
 
 
478 aa  175  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.357562  normal  0.109764 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0737  hypothetical protein  27.52 
 
 
482 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.509556  normal  0.0133056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0222  hypothetical protein  29.13 
 
 
488 aa  175  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00993068 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0838  hypothetical protein  29.62 
 
 
480 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0048  hypothetical protein  29.5 
 
 
484 aa  173  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1446  hypothetical protein  29.67 
 
 
482 aa  171  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0780  hypothetical protein  29.84 
 
 
481 aa  169  7e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0518  hypothetical protein  27.73 
 
 
482 aa  168  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.566512  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0017  hypothetical protein  28.45 
 
 
484 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2185  hypothetical protein  29.32 
 
 
510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1630  hypothetical protein  27.72 
 
 
486 aa  163  8.000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2278  hypothetical protein  28.54 
 
 
494 aa  162  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03600  hypothetical protein  28.15 
 
 
510 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0742  hypothetical protein  30.51 
 
 
412 aa  143  6e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1131  hypothetical protein  29.12 
 
 
489 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3740  hypothetical protein  26.22 
 
 
485 aa  130  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3942  hypothetical protein  28.3 
 
 
482 aa  120  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1123  hypothetical protein  24.81 
 
 
488 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.963285 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17220  hypothetical protein  27.53 
 
 
477 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.96015  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3698  hypothetical protein  26.86 
 
 
499 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268851  decreased coverage  0.000278839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03250  hypothetical protein  26.79 
 
 
538 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127047  unclonable  2.10051e-21 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2222  hypothetical protein  25.7 
 
 
499 aa  92  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49830  hypothetical protein  27.88 
 
 
450 aa  88.6  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2029  hypothetical protein  31.51 
 
 
490 aa  84  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2066  hypothetical protein  24.32 
 
 
502 aa  80.9  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0285936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0627  hypothetical protein  30.6 
 
 
176 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0271  hypothetical protein  24.26 
 
 
507 aa  66.6  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  decreased coverage  0.00169568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1174  hypothetical protein  22.38 
 
 
485 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.180277  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5157  hypothetical protein  25 
 
 
496 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265097  normal  0.0750185 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>