36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1811 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1811  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  968    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0901  hypothetical protein  81.74 
 
 		 483 aa  774    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0797032  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0737  hypothetical protein  77.55 
 
 		 482 aa  778    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.509556  normal  0.0133056 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0780  hypothetical protein  79.83 
 
 		 481 aa  753    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0017  hypothetical protein  69.21 
 
 		 484 aa  659    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1446  hypothetical protein  81.5 
 
 		 482 aa  774    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0838  hypothetical protein  81.04 
 
 		 480 aa  773    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0518  hypothetical protein  76.51 
 
 		 482 aa  763    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.566512  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0048  hypothetical protein  66.32 
 
 		 484 aa  620  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0222  hypothetical protein  64.2 
 
 		 488 aa  610  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00993068 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2185  hypothetical protein  57.46 
 
 		 510 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2278  hypothetical protein  57.46 
 
 		 494 aa  559  1e-158  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2296  hypothetical protein  54.18 
 
 		 478 aa  522  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.357562  normal  0.109764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1630  hypothetical protein  49.38 
 
 		 486 aa  473  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03600  hypothetical protein  51.35 
 
 		 510 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0742  hypothetical protein  63.77 
 
 		 412 aa  451  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1131  hypothetical protein  49.21 
 
 		 489 aa  402  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4005  hypothetical protein  30.28 
 
 		 489 aa  194  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0110668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03537  hypothetical protein  31.62 
 
 		 490 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3164  hypothetical protein  29.83 
 
 		 487 aa  179  9e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0627  hypothetical protein  47.73 
 
 		 176 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0870  hypothetical protein  28.3 
 
 		 490 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1123  hypothetical protein  26.65 
 
 		 488 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.963285 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26590  hypothetical protein  27.44 
 
 		 515 aa  139  7.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22890  Methyl-accepting chemotaxis protein  29.81 
 
 		 487 aa  122  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03250  hypothetical protein  25.74 
 
 		 538 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127047  unclonable  2.10051e-21 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0065  hypothetical protein  22.6 
 
 		 492 aa  95.5  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.950662  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3698  hypothetical protein  24.2 
 
 		 499 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268851  decreased coverage  0.000278839 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49830  hypothetical protein  24.19 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3740  hypothetical protein  25 
 
 		 485 aa  62  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2222  hypothetical protein  26.57 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2029  hypothetical protein  28.24 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1567  hypothetical protein  22.73 
 
 		 522 aa  57  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3942  hypothetical protein  24.71 
 
 		 482 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17220  hypothetical protein  26.36 
 
 		 477 aa  48.5  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.96015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5157  hypothetical protein  23.34 
 
 		 496 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265097  normal  0.0750185 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>