37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1630 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1630  hypothetical protein  100 
 
 
486 aa  967    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03600  hypothetical protein  59.83 
 
 
510 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0017  hypothetical protein  53.1 
 
 
484 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0737  hypothetical protein  49.17 
 
 
482 aa  477  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.509556  normal  0.0133056 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1811  hypothetical protein  49.38 
 
 
481 aa  473  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0222  hypothetical protein  50.82 
 
 
488 aa  469  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00993068 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0518  hypothetical protein  48.75 
 
 
482 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.566512  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0838  hypothetical protein  49.17 
 
 
480 aa  462  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2296  hypothetical protein  48.33 
 
 
478 aa  460  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.357562  normal  0.109764 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0048  hypothetical protein  51.86 
 
 
484 aa  460  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1131  hypothetical protein  53.96 
 
 
489 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1446  hypothetical protein  48.33 
 
 
482 aa  444  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0901  hypothetical protein  48.23 
 
 
483 aa  442  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0797032  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0780  hypothetical protein  48.96 
 
 
481 aa  445  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2278  hypothetical protein  47.26 
 
 
494 aa  434  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2185  hypothetical protein  47.03 
 
 
510 aa  429  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0742  hypothetical protein  55.36 
 
 
412 aa  384  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4005  hypothetical protein  30.91 
 
 
489 aa  166  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0110668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03537  hypothetical protein  29.5 
 
 
490 aa  157  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3164  hypothetical protein  27.44 
 
 
487 aa  157  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0627  hypothetical protein  45.98 
 
 
176 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26590  hypothetical protein  26 
 
 
515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1123  hypothetical protein  27.73 
 
 
488 aa  140  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.963285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0870  hypothetical protein  26.8 
 
 
490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282403  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0065  hypothetical protein  22.52 
 
 
492 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.950662  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22890  Methyl-accepting chemotaxis protein  25.86 
 
 
487 aa  101  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03250  hypothetical protein  27.41 
 
 
538 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127047  unclonable  2.10051e-21 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49830  hypothetical protein  27.72 
 
 
450 aa  83.6  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3698  hypothetical protein  25.83 
 
 
499 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268851  decreased coverage  0.000278839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0271  hypothetical protein  27.53 
 
 
507 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  decreased coverage  0.00169568 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3740  hypothetical protein  22.55 
 
 
485 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2222  hypothetical protein  25.29 
 
 
499 aa  51.2  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5157  hypothetical protein  23.58 
 
 
496 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265097  normal  0.0750185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1174  hypothetical protein  25.53 
 
 
485 aa  44.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.180277  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0871  hypothetical protein  24.06 
 
 
480 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566977  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0882  hypothetical protein  24.06 
 
 
480 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104692  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0865  hypothetical protein  24.06 
 
 
480 aa  43.1  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>