35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2029 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2029  hypothetical protein  100 
 
 
490 aa  949    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17220  hypothetical protein  67.03 
 
 
477 aa  604  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.96015  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2222  hypothetical protein  62.99 
 
 
499 aa  531  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1567  hypothetical protein  36.82 
 
 
522 aa  275  9e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0271  hypothetical protein  37.82 
 
 
507 aa  236  7e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  decreased coverage  0.00169568 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4005  hypothetical protein  28.24 
 
 
489 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0110668 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0065  hypothetical protein  29.9 
 
 
492 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.950662  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22890  Methyl-accepting chemotaxis protein  29.78 
 
 
487 aa  102  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3740  hypothetical protein  26.98 
 
 
485 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3942  hypothetical protein  26.02 
 
 
482 aa  100  6e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3164  hypothetical protein  31.51 
 
 
487 aa  92.8  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0870  hypothetical protein  28.78 
 
 
490 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282403  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03537  hypothetical protein  29 
 
 
490 aa  90.9  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0737  hypothetical protein  27.97 
 
 
482 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.509556  normal  0.0133056 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0518  hypothetical protein  25.85 
 
 
482 aa  74.7  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.566512  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03250  hypothetical protein  27.11 
 
 
538 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127047  unclonable  2.10051e-21 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1446  hypothetical protein  31.54 
 
 
482 aa  66.6  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0017  hypothetical protein  27.76 
 
 
484 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1811  hypothetical protein  29.66 
 
 
481 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0838  hypothetical protein  30.29 
 
 
480 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0780  hypothetical protein  30.71 
 
 
481 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3698  hypothetical protein  26.9 
 
 
499 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268851  decreased coverage  0.000278839 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0901  hypothetical protein  29.17 
 
 
483 aa  63.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0797032  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2185  hypothetical protein  24.92 
 
 
510 aa  60.8  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2278  hypothetical protein  24.92 
 
 
494 aa  60.5  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26590  hypothetical protein  22.96 
 
 
515 aa  57.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2296  hypothetical protein  25.48 
 
 
478 aa  55.1  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.357562  normal  0.109764 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49830  hypothetical protein  26.51 
 
 
450 aa  53.5  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0048  hypothetical protein  27.07 
 
 
484 aa  52.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0222  hypothetical protein  25.23 
 
 
488 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00993068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1131  hypothetical protein  26.28 
 
 
489 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03600  hypothetical protein  23.95 
 
 
510 aa  48.9  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0742  hypothetical protein  25.56 
 
 
412 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2066  hypothetical protein  24.08 
 
 
502 aa  45.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0285936  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1630  hypothetical protein  24.21 
 
 
486 aa  44.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>