25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2066 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2066  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  995    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0285936  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0871  hypothetical protein  27.2 
 
 		 480 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0865  hypothetical protein  26.99 
 
 		 480 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0882  hypothetical protein  26.99 
 
 		 480 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5157  hypothetical protein  25.27 
 
 		 496 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265097  normal  0.0750185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2511  hypothetical protein  27.54 
 
 		 511 aa  103  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.398866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1174  hypothetical protein  24.89 
 
 		 485 aa  96.7  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0065  hypothetical protein  21.98 
 
 		 492 aa  93.6  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.950662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22890  Methyl-accepting chemotaxis protein  26.65 
 
 		 487 aa  91.7  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4005  hypothetical protein  25.38 
 
 		 489 aa  86.7  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0110668 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03537  hypothetical protein  25.12 
 
 		 490 aa  86.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3164  hypothetical protein  24.32 
 
 		 487 aa  83.6  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26590  hypothetical protein  26.01 
 
 		 515 aa  82.8  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3740  hypothetical protein  25.55 
 
 		 485 aa  80.1  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0870  hypothetical protein  25.26 
 
 		 490 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1567  hypothetical protein  26.35 
 
 		 522 aa  69.3  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3942  hypothetical protein  22.96 
 
 		 482 aa  67.8  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49830  hypothetical protein  25 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03250  hypothetical protein  27.14 
 
 		 538 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127047  unclonable  2.10051e-21 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3698  hypothetical protein  25 
 
 		 499 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268851  decreased coverage  0.000278839 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1131  hypothetical protein  24.18 
 
 		 489 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1123  hypothetical protein  22.91 
 
 		 488 aa  54.3  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.963285 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03600  hypothetical protein  24.64 
 
 		 510 aa  51.2  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17220  hypothetical protein  25.9 
 
 		 477 aa  48.5  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.96015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0017  hypothetical protein  24.9 
 
 		 484 aa  43.9  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>