More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2017 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2017  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 		 343 aa  693    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1940  transcriptional regulator CysB-like protein  99.42 
 
 		 343 aa  691    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3209  transcriptional regulator CysB-like protein  79.45 
 
 		 327 aa  525  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.764031 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02125  transcriptional regulator CysB-like protein  80.67 
 
 		 327 aa  511  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.455963  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1928  transcriptional regulator CysB  39.1 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0221409  hitchhiker  0.0000000000199307 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2327  transcriptional regulator CysB  39.1 
 
 		 324 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184075  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1768  transcriptional regulator CysB  38.78 
 
 		 324 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000142013 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3443  transcriptional regulator CysB  39.1 
 
 		 324 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0457028  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4003  transcriptional regulator CysB  38.78 
 
 		 324 aa  229  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.260583  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23140  transcriptional regulator CysB  39.1 
 
 		 324 aa  229  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2279  Cys regulon transcriptional activator  39.1 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0003435  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2546  transcriptional regulator CysB  38.78 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000891923 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2077  transcriptional regulator CysB  38.78 
 
 		 324 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2428  transcriptional regulator CysB  41.61 
 
 		 323 aa  225  8e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1667  transcriptional regulator CysB  38.39 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00185974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3553  transcriptional regulator CysB  38.78 
 
 		 324 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41870  transcriptional regulator CysB  38.78 
 
 		 324 aa  222  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2469  transcriptional regulator CysB  40.2 
 
 		 324 aa  222  9e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1979  transcriptional regulator CysB  38.05 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1583  transcriptional regulator CysB  39.53 
 
 		 325 aa  218  7.999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2161  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.281423  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2195  transcriptional regulator CysB  38.93 
 
 		 324 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000422628 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1145  transcriptional regulator CysB-like protein  40.47 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207377  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1840  transcriptional regulator CysB  38.59 
 
 		 324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000484032 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1615  transcriptional regulator CysB  38.59 
 
 		 324 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000907367 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01945  transcriptional regulator CysB  38.03 
 
 		 324 aa  216  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00567188  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1497  transcriptional regulator CysB  37.58 
 
 		 324 aa  216  5e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000166035  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1844  transcriptional regulator CysB  38.59 
 
 		 324 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00679598 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1434  transcriptional regulator CysB  38.59 
 
 		 324 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237388  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1902  transcriptional regulator CysB  38.59 
 
 		 324 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  hitchhiker  4.2824e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2016  transcriptional regulator CysB  38.59 
 
 		 324 aa  216  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01251  DNA-binding transcriptional dual regulator, O-acetyl-L-serine-binding  38.93 
 
 		 324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2374  transcriptional regulator, LysR family  38.93 
 
 		 324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00240492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01261  hypothetical protein  38.93 
 
 		 324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.234561  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1384  transcriptional regulator CysB  38.93 
 
 		 324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2353  transcriptional regulator CysB  38.93 
 
 		 324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0011024  unclonable  0.000000022716 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1501  transcriptional regulator CysB  38.93 
 
 		 324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.7918  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1907  transcriptional regulator CysB  38.93 
 
 		 324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0524894  hitchhiker  2.34231e-17 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1856  transcriptional regulator CysB  38.93 
 
 		 324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.314733  hitchhiker  2.57931e-19 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1475  transcriptional regulator CysB  38.93 
 
 		 324 aa  216  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00044374  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1697  transcriptional regulator CysB  40.52 
 
 		 326 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828749 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2317  transcriptional regulator CysB  38.59 
 
 		 324 aa  215  7e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1923  transcriptional regulator, LysR family  38.26 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1033  transcriptional regulator CysB  38.59 
 
 		 323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.113266  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003883  regulatory protein CysB  37.25 
 
 		 324 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.803514  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2248  transcriptional regulator CysB  36.91 
 
 		 325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.841929  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2341  transcriptional regulator CysB  38.74 
 
 		 335 aa  212  7e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00664929 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0301  transcriptional regulator CysB  37.92 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1450  transcriptional regulator CysB  35.91 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000786748  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01793  transcriptional regulator CysB  38.33 
 
 		 324 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1669  transcriptional regulator CysB-like protein  37.38 
 
 		 312 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0453898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1624  transcriptional regulator CysB  36.39 
 
 		 324 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.483368  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2228  transcriptional regulator CysB  39.13 
 
 		 324 aa  210  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000587269  hitchhiker  0.00110252 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2032  transcriptional regulator CysB  39.13 
 
 		 324 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.30659  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1922  transcriptional regulator CysB  39.13 
 
 		 324 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.303693  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2656  transcriptional regulator CysB  38.59 
 
 		 324 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00546956  unclonable  0.0000000382364 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0847  transcriptional regulator, LysR family  35.95 
 
 		 320 aa  209  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.960379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0699  sulfur assimilation transcriptional regulator, LysR family  35.95 
 
 		 320 aa  209  4e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.735105  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1805  transcriptional regulator CysB  36.91 
 
 		 324 aa  209  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  0.0101242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2649  transcriptional regulator CysB  36.58 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1587  transcriptional regulator CysB  36.58 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296126  normal  0.104148 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1662  transcriptional regulator CysB  36.58 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0319237  unclonable  0.0000181404 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1731  transcriptional regulator CysB  36.58 
 
 		 324 aa  208  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00171097  normal  0.293254 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1689  transcriptional regulator CysB  36.58 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.372652  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3810  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1296  transcriptional regulator, LysR family  35.62 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1324  transcriptional regulator CysB  37.25 
 
 		 324 aa  207  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2494  transcriptional regulator CysB  36.67 
 
 		 327 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0621  transcriptional regulator CysB-like protein  39.26 
 
 		 309 aa  206  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2487  transcriptional regulator CysB  36.67 
 
 		 327 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343529  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2607  transcriptional regulator CysB  36.67 
 
 		 327 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00558949  decreased coverage  0.000632462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1857  transcriptional regulator CysB  36.67 
 
 		 327 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00369362  decreased coverage  0.00000000217707 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0963  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 308 aa  206  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1624  transcriptional regulator CysB  35.91 
 
 		 324 aa  206  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.239161  normal  0.11593 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2839  transcriptional regulator CysB  36.24 
 
 		 324 aa  205  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  hitchhiker  0.00000219555 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2096  transcriptional regulator CysB  35.23 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00807982  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1537  transcriptional regulator CysB  35.91 
 
 		 324 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000242596  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0341  transcriptional regulator CysB  39.27 
 
 		 333 aa  202  8e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2726  transcriptional regulator CysB-like protein  35.99 
 
 		 313 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.634553  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2236  transcriptional regulator CysB-like protein  36.13 
 
 		 313 aa  199  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0127  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 311 aa  199  7e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191807  hitchhiker  0.00233416 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5610  LysR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 354 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2481  transcriptional regulator CysB-like protein  36.33 
 
 		 313 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2393  transcriptional regulator CysB-like protein  36.01 
 
 		 313 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  36.33 
 
 		 313 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2525  transcriptional regulator CysB-like protein  36.01 
 
 		 313 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2476  transcriptional regulator CysB-like protein  36.33 
 
 		 313 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14516  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3535  transcriptional regulator CysB-like protein  36.1 
 
 		 326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1200  transcriptional regulator CysB  34.49 
 
 		 324 aa  196  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1739  transcriptional regulator CysB-like protein  36.75 
 
 		 314 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000279611  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5807  transcriptional regulator CysB-like protein  36.01 
 
 		 313 aa  196  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0818  transcriptional regulator CysB-like protein  35.69 
 
 		 313 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1625  transcriptional regulator CysB-like protein  37.42 
 
 		 308 aa  195  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879627  normal  0.658708 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2292  transcriptional regulator CysB-like protein  36 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.524252  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3166  transcriptional regulator CysB-like protein  35.39 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2404  transcriptional regulator CysB-like protein  35.06 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.044463  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0969  transcriptional regulator CysB-like protein  35.05 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0800  transcriptional regulator CysB-like protein  36.48 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0813  transcriptional regulator CysB-like protein  35.48 
 
 		 313 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3665  transcriptional regulator CysB-like protein  34.73 
 
 		 313 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.891363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>