More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3415 on replicon NC_013531
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013531  Xcel_3415  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
304 aa  613  9.999999999999999e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4710  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40 
 
 
263 aa  109  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  34.19 
 
 
370 aa  102  7e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.26 
 
 
278 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25090  chromosome partitioning ATPase  29.05 
 
 
305 aa  101  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.419611  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4883  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.22 
 
 
258 aa  99.8  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.22 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  32.63 
 
 
257 aa  96.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4190  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.2 
 
 
274 aa  96.7  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.91 
 
 
256 aa  96.3  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1299  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.91 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.987107  normal  0.450444 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  32.03 
 
 
257 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  27.59 
 
 
256 aa  94.4  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3111  chromosome segregation ATPase  31.11 
 
 
345 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0702646  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6481  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.28 
 
 
314 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6072  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.63 
 
 
318 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.235979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.37 
 
 
303 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  31.11 
 
 
258 aa  93.6  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2806  chromosome segregation ATPase  29.87 
 
 
261 aa  94  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0253232  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.26 
 
 
262 aa  93.6  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0095  cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.33 
 
 
259 aa  93.2  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.740552  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7093  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.74 
 
 
339 aa  92.8  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0834  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.84 
 
 
336 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0086  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.61 
 
 
259 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.368871  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3318  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.9 
 
 
256 aa  91.3  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.39 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5783  chromosome segregation ATPase  32.89 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416241 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0096  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.61 
 
 
259 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.560799  normal  0.715658 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5407  chromosome segregation ATPase  32.89 
 
 
335 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0002  chromosome segregation ATPase  32.89 
 
 
335 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268722  normal  0.191041 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3365  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.9 
 
 
256 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.9 
 
 
256 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  32.9 
 
 
256 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1597  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.9 
 
 
256 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00287402  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4858  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.45 
 
 
315 aa  90.9  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  32.9 
 
 
256 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2960  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.33 
 
 
259 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4295  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.22 
 
 
265 aa  90.5  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3980  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  32.9 
 
 
256 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.33 
 
 
259 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  32.9 
 
 
256 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0112  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.61 
 
 
259 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.53 
 
 
265 aa  90.5  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.3 
 
 
317 aa  90.1  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.52 
 
 
346 aa  90.1  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4374  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.88 
 
 
262 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0660919  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1442  chromosome partitioning ATPase  34.45 
 
 
323 aa  89.7  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.526471  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3535  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.62 
 
 
276 aa  89.7  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  31.22 
 
 
264 aa  89.7  6e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4375  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.43 
 
 
262 aa  89  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000180218  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3277  chromosome segregation ATPase  32.17 
 
 
259 aa  89.4  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.161475  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4319  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.43 
 
 
262 aa  89  8e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383925  hitchhiker  0.000000000127935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4516  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.43 
 
 
262 aa  89  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518316  hitchhiker  0.00306238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5739  chromosome segregation ATPase  31.42 
 
 
265 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268007  normal  0.444279 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.17 
 
 
265 aa  88.6  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2867  chromosome segregation ATPase  31.17 
 
 
270 aa  89  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.136674  normal  0.0907735 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4694  chromosome segregation ATPase  31.3 
 
 
361 aa  88.6  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0801275  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0017  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.77 
 
 
256 aa  88.2  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.405459  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4756  ParA family protein  32.88 
 
 
262 aa  88.2  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13953  chromosome partitioning protein parA  32.14 
 
 
347 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.88 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.54 
 
 
301 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2175  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.48 
 
 
255 aa  88.2  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000290082  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  34.78 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3314  chromosome segregation ATPase  31.03 
 
 
264 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0881849  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  29.6 
 
 
266 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0030  chromosome segregation ATPase  33.48 
 
 
263 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.98 
 
 
278 aa  87.8  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.58378  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0113  chromosome segregation ATPase  30.12 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4139  chromosome segregation ATPase  32.88 
 
 
262 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.422385  hitchhiker  0.000125967 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.42 
 
 
264 aa  87.8  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  33.48 
 
 
268 aa  87.4  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.67 
 
 
437 aa  87  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4507  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.78 
 
 
462 aa  87  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013089 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.48 
 
 
304 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.8 
 
 
257 aa  86.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3293  chromosome segregation ATPase  30.69 
 
 
255 aa  86.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3164  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.28 
 
 
259 aa  87  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.31 
 
 
269 aa  87  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27233  normal  0.241063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2365  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.04 
 
 
256 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.909103  normal  0.144806 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4054  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.25 
 
 
262 aa  86.3  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3751  chromosome segregation ATPase  31.22 
 
 
257 aa  86.7  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626525  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.18 
 
 
265 aa  86.3  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0014  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.46 
 
 
256 aa  86.3  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386166  hitchhiker  0.000800579 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.25 
 
 
433 aa  86.3  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1397  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.55 
 
 
257 aa  86.3  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000218596  hitchhiker  0.000285063 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.63 
 
 
265 aa  86.3  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  32.43 
 
 
262 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  32.43 
 
 
262 aa  86.3  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.24 
 
 
392 aa  86.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0426351  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.83 
 
 
256 aa  85.9  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  31.7 
 
 
275 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.84 
 
 
279 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23420  chromosome segregation ATPase  31.54 
 
 
315 aa  85.9  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.43 
 
 
263 aa  85.9  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.49 
 
 
256 aa  85.9  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2947  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.84 
 
 
290 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.297799  normal  0.346271 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2976  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.84 
 
 
290 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3739  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31 
 
 
257 aa  85.9  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.512562  normal  0.176077 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  31.49 
 
 
256 aa  85.9  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.158889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>