26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1590 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1590  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
365 aa  686    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3177  protein of unknown function DUF214  87.29 
 
 
378 aa  526  1e-148  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0851  protein of unknown function DUF214  71.86 
 
 
374 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1581  protein of unknown function DUF214  68.66 
 
 
374 aa  375  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09490  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.08 
 
 
364 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.457964  normal  0.625524 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0084  protein of unknown function DUF214  30.03 
 
 
367 aa  84.7  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.650398 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21590  Predicted permease  31.61 
 
 
364 aa  76.6  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  36.57 
 
 
438 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  31.25 
 
 
386 aa  50.4  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  25.75 
 
 
393 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13630  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  35.14 
 
 
392 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.422121 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7745  hypothetical protein  29.82 
 
 
445 aa  47  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161151  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  30.43 
 
 
413 aa  46.6  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4329  protein of unknown function DUF214  29.15 
 
 
407 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4326  ABC transporter related protein  34.26 
 
 
391 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361609  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  32.41 
 
 
866 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  25.91 
 
 
397 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  28.24 
 
 
655 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  33.02 
 
 
854 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  35.8 
 
 
853 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  27.18 
 
 
397 aa  43.9  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  32 
 
 
378 aa  43.5  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  26.91 
 
 
488 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2964  protein of unknown function DUF214  26.88 
 
 
415 aa  43.1  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7079  protein of unknown function DUF214  29.57 
 
 
452 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.57 
 
 
812 aa  42.7  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>