98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0949 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0949  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
124 aa  257  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5441  hypothetical protein  80 
 
 
125 aa  210  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0509  4-oxalocrotonate tautomerase  73.81 
 
 
126 aa  194  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.380197  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4181  4-oxalocrotonate tautomerase  69.05 
 
 
126 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.668909  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4561  4-oxalocrotonate tautomerase  65.08 
 
 
127 aa  172  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0161169  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2853  hypothetical protein  55.56 
 
 
127 aa  145  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2767  4-oxalocrotonate tautomerase  52.46 
 
 
126 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4401  4-oxalocrotonate tautomerase  53.97 
 
 
127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.037596 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2018  4-oxalocrotonate tautomerase  54.76 
 
 
126 aa  137  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.651181 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2241  4-oxalocrotonate tautomerase  52.38 
 
 
127 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280838  normal  0.0465075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4509  4-oxalocrotonate tautomerase  52.38 
 
 
127 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0981308  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3855  4-oxalocrotonate tautomerase  52.38 
 
 
127 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243179  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3672  4-oxalocrotonate tautomerase  52.38 
 
 
127 aa  135  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4890  4-oxalocrotonate tautomerase  52.38 
 
 
127 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100984  hitchhiker  0.0008433 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3113  4-oxalocrotonate tautomerase  53.17 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3223  4-oxalocrotonate tautomerase  49.21 
 
 
127 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858973  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3752  4-oxalocrotonate tautomerase  49.21 
 
 
127 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317279  normal  0.179922 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0588  tautomerase enzyme family protein  50 
 
 
127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2435  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119976  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0324  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2571  tautomerase enzyme family protein  50 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0873  tautomerase enzyme family protein  50 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1669  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0292  tautomerase enzyme family protein  50 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1472  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 
127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.329573  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3285  4-oxalocrotonate tautomerase  47.54 
 
 
139 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3586  4-oxalocrotonate tautomerase  45.9 
 
 
139 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398281  normal  0.0590497 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0302  4-oxalocrotonate tautomerase  44.26 
 
 
131 aa  107  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0880  4-oxalocrotonate tautomerase  47.11 
 
 
126 aa  107  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4668  4-oxalocrotonate tautomerase  41.32 
 
 
127 aa  107  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744907  normal  0.547814 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3211  4-oxalocrotonate tautomerase  42.98 
 
 
126 aa  102  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00825864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1896  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 
136 aa  100  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3399  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 
127 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1736  4-oxalocrotonate tautomerase  42.28 
 
 
127 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1663  4-oxalocrotonate tautomerase  43.09 
 
 
127 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0155634  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2211  4-oxalocrotonate tautomerase  42.28 
 
 
127 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00393274  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2961  4-oxalocrotonate tautomerase  35.54 
 
 
134 aa  87.4  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2646  acyloate catabolism-like protein  36.51 
 
 
130 aa  87  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.391983  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1460  putative tautomerase  36.36 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5129  4-oxalocrotonate tautomerase  34.65 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741439  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0162  4-oxalocrotonate tautomerase  34.71 
 
 
130 aa  77.8  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2757  4-oxalocrotonate tautomerase  34.68 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.23 
 
 
244 aa  72  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2423  4-oxalocrotonate tautomerase  32.23 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0210887 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4228  4-oxalocrotonate tautomerase  34.4 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2146  4-oxalocrotonate tautomerase  31.4 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.232573  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2106  4-oxalocrotonate tautomerase  31.4 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501901 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2038  hypothetical protein  28.57 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.247889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1939  hypothetical protein  26.19 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1974  hypothetical protein  26.19 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.213e-16 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7514  4-oxalocrotonate tautomerase  31.4 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1799  hypothetical protein  26.19 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2017  hypothetical protein  26.98 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.333097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1756  hypothetical protein  26.98 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4134  4-oxalocrotonate tautomerase  34.65 
 
 
272 aa  67.8  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1751  4-oxalocrotonate tautomerase  26.77 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00944027  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1817  4-oxalocrotonate tautomerase  32.23 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200141 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5462  4-oxalocrotonate tautomerase  26.19 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0307831  normal  0.0551368 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8518  4-oxalocrotonate tautomerase  28.93 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0936  4-oxalocrotonate tautomerase  28.93 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6040  4-oxalocrotonate tautomerase  34.78 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.868812  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3857  4-oxalocrotonate tautomerase  27.87 
 
 
129 aa  56.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00692492  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1717  hypothetical protein  28.1 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0609  tautomerase  30.08 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6826  4-oxalocrotonate tautomerase  25.62 
 
 
129 aa  53.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.683318 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2075  4-oxalocrotonate tautomerase  28.44 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.356466  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.25 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0810  hypothetical protein  26.67 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3465  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  36.54 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2409  hypothetical protein  25.83 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125635  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  38.46 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3355  4-oxalocrotonate tautomerase  32.69 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484122  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5693  4-oxalocrotonate tautomerase  39.22 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0227  4-oxalocrotonate tautomerase  39.22 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6046  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  32 
 
 
64 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153664  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5507  4-oxalocrotonate tautomerase  34.62 
 
 
61 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5226  4-oxalocrotonate tautomerase  34.62 
 
 
61 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5057  4-oxalocrotonate tautomerase  34.62 
 
 
61 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5074  4-oxalocrotonate tautomerase  34.62 
 
 
61 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5626  4-oxalocrotonate tautomerase  34.62 
 
 
61 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3899  4-oxalocrotonate tautomerase  34.62 
 
 
61 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4534  4-oxalocrotonate tautomerase  38.46 
 
 
62 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.199758 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5556  4-oxalocrotonate tautomerase  34.62 
 
 
61 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5450  4-oxalocrotonate tautomerase  34.62 
 
 
61 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3104  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  38.78 
 
 
63 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0069349  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5171  4-oxalocrotonate tautomerase  34.62 
 
 
61 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5470  4-oxalocrotonate tautomerase  34.62 
 
 
61 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5500  4-oxalocrotonate tautomerase  34.62 
 
 
61 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4075  4-oxalocrotonate tautomerase  38.46 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.86999  normal  0.876774 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4012  4-oxalocrotonate tautomerase  36.54 
 
 
62 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.84694 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3686  4-oxalocrotonate tautomerase  36.54 
 
 
62 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5619  4-oxalocrotonate tautomerase  36.54 
 
 
62 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.856115  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4681  4-oxalocrotonate tautomerase  36.54 
 
 
62 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.037067 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1081  transglutaminase-like  26.6 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3540  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.25 
 
 
63 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963519  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  36.73 
 
 
62 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  36.73 
 
 
62 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4616  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.25 
 
 
63 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.954755  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>