78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6040 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6040  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
137 aa  282  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.868812  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0588  tautomerase enzyme family protein  35.78 
 
 
127 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0292  tautomerase enzyme family protein  33.94 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0873  tautomerase enzyme family protein  33.94 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0324  4-oxalocrotonate tautomerase  33.94 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2435  4-oxalocrotonate tautomerase  33.94 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119976  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2571  tautomerase enzyme family protein  33.94 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1669  4-oxalocrotonate tautomerase  33.94 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1472  4-oxalocrotonate tautomerase  33.94 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.329573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4668  4-oxalocrotonate tautomerase  31.71 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744907  normal  0.547814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2211  4-oxalocrotonate tautomerase  33.93 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00393274  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1663  4-oxalocrotonate tautomerase  33.04 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0155634  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4509  4-oxalocrotonate tautomerase  32.38 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0981308  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3855  4-oxalocrotonate tautomerase  32.38 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243179  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3672  4-oxalocrotonate tautomerase  32.38 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1736  4-oxalocrotonate tautomerase  33.04 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3211  4-oxalocrotonate tautomerase  32.48 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00825864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2853  hypothetical protein  30.84 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2018  4-oxalocrotonate tautomerase  30.28 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.651181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4561  4-oxalocrotonate tautomerase  30.33 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0161169  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3113  4-oxalocrotonate tautomerase  30.58 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0949  4-oxalocrotonate tautomerase  33.61 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2767  4-oxalocrotonate tautomerase  28.69 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0509  4-oxalocrotonate tautomerase  30.33 
 
 
126 aa  67  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.380197  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3399  4-oxalocrotonate tautomerase  27.88 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3223  4-oxalocrotonate tautomerase  31.43 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858973  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3752  4-oxalocrotonate tautomerase  31.43 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317279  normal  0.179922 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4181  4-oxalocrotonate tautomerase  30.16 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.668909  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0302  4-oxalocrotonate tautomerase  30.36 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2241  4-oxalocrotonate tautomerase  30.48 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280838  normal  0.0465075 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4401  4-oxalocrotonate tautomerase  31.43 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.037596 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5462  4-oxalocrotonate tautomerase  25.6 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0307831  normal  0.0551368 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1756  hypothetical protein  26.98 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2038  hypothetical protein  26.98 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.247889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1974  hypothetical protein  26.19 
 
 
135 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.213e-16 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4890  4-oxalocrotonate tautomerase  30.48 
 
 
127 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100984  hitchhiker  0.0008433 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1939  hypothetical protein  26.19 
 
 
135 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1799  hypothetical protein  26.19 
 
 
135 aa  62.8  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2757  4-oxalocrotonate tautomerase  31.71 
 
 
130 aa  62  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3285  4-oxalocrotonate tautomerase  33.63 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1751  4-oxalocrotonate tautomerase  26.19 
 
 
137 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00944027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2017  hypothetical protein  26.19 
 
 
135 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.333097  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0880  4-oxalocrotonate tautomerase  29.35 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5441  hypothetical protein  31.15 
 
 
125 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0810  hypothetical protein  31.11 
 
 
131 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  30.51 
 
 
244 aa  57.4  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3586  4-oxalocrotonate tautomerase  32.04 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398281  normal  0.0590497 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4228  4-oxalocrotonate tautomerase  27.87 
 
 
131 aa  54.3  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2646  acyloate catabolism-like protein  24.53 
 
 
130 aa  53.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.391983  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2961  4-oxalocrotonate tautomerase  25 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1717  hypothetical protein  29.23 
 
 
129 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8518  4-oxalocrotonate tautomerase  30.08 
 
 
129 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7514  4-oxalocrotonate tautomerase  28.18 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1817  4-oxalocrotonate tautomerase  30.08 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4134  4-oxalocrotonate tautomerase  28.7 
 
 
272 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1460  putative tautomerase  22.73 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2409  hypothetical protein  24.77 
 
 
129 aa  45.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125635  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0162  4-oxalocrotonate tautomerase  26.67 
 
 
130 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0663  4-oxalocrotonate tautomerase  47.06 
 
 
62 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282079  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2146  4-oxalocrotonate tautomerase  27.87 
 
 
129 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.232573  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2423  4-oxalocrotonate tautomerase  28.18 
 
 
129 aa  42.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0210887 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0325  4-oxalocrotonate tautomerase  44.44 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0336  4-oxalocrotonate tautomerase  44.44 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1896  4-oxalocrotonate tautomerase  27.36 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0808  4-oxalocrotonate tautomerase  42.22 
 
 
62 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.159004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4532  4-oxalocrotonate tautomerase  43.14 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000289924  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2075  4-oxalocrotonate tautomerase  29.73 
 
 
127 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.356466  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0405  4-oxalocrotonate tautomerase  43.14 
 
 
62 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32737  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3733  4-oxalocrotonate tautomerase  42.22 
 
 
63 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0165107 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2106  4-oxalocrotonate tautomerase  27.05 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501901 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1637  4-oxalocrotonate tautomerase  43.14 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.727526  normal  0.995863 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2262  hypothetical protein  28.23 
 
 
129 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0823  4-oxalocrotonate tautomerase  42.22 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.371089  normal  0.237608 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30590  4-oxalocrotonate isomerase; LapI  35.19 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000000517706  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0753  4-oxalocrotonate tautomerase  42.22 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.293685 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2265  putative 4-oxalocrotonate isomerase protein  40 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3857  4-oxalocrotonate tautomerase  25.69 
 
 
129 aa  40.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00692492  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1809  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
63 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.105316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>