69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3855 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4509  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
127 aa  261  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0981308  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3672  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
127 aa  261  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3855  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
127 aa  261  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243179  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2241  4-oxalocrotonate tautomerase  90.55 
 
 
127 aa  243  9e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280838  normal  0.0465075 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3752  4-oxalocrotonate tautomerase  87.4 
 
 
127 aa  236  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317279  normal  0.179922 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3223  4-oxalocrotonate tautomerase  87.4 
 
 
127 aa  236  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858973  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4890  4-oxalocrotonate tautomerase  86.61 
 
 
127 aa  233  9e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100984  hitchhiker  0.0008433 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2853  hypothetical protein  71.65 
 
 
127 aa  203  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0588  tautomerase enzyme family protein  77.6 
 
 
127 aa  203  7e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0324  4-oxalocrotonate tautomerase  77.6 
 
 
127 aa  201  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2435  4-oxalocrotonate tautomerase  77.6 
 
 
127 aa  201  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119976  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0873  tautomerase enzyme family protein  77.6 
 
 
127 aa  201  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2571  tautomerase enzyme family protein  77.6 
 
 
127 aa  201  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1669  4-oxalocrotonate tautomerase  77.6 
 
 
127 aa  201  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1472  4-oxalocrotonate tautomerase  77.6 
 
 
127 aa  201  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.329573  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0292  tautomerase enzyme family protein  77.6 
 
 
127 aa  201  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4401  4-oxalocrotonate tautomerase  72.44 
 
 
127 aa  200  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.037596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0509  4-oxalocrotonate tautomerase  61.9 
 
 
126 aa  170  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.380197  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3113  4-oxalocrotonate tautomerase  60.32 
 
 
126 aa  168  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4181  4-oxalocrotonate tautomerase  61.11 
 
 
126 aa  167  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.668909  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2767  4-oxalocrotonate tautomerase  64.8 
 
 
126 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4561  4-oxalocrotonate tautomerase  57.48 
 
 
127 aa  164  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0161169  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2018  4-oxalocrotonate tautomerase  57.94 
 
 
126 aa  154  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.651181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5441  hypothetical protein  53.17 
 
 
125 aa  141  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3211  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 
126 aa  138  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00825864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0949  4-oxalocrotonate tautomerase  52.38 
 
 
124 aa  135  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4668  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 
127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744907  normal  0.547814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3285  4-oxalocrotonate tautomerase  51.61 
 
 
139 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3586  4-oxalocrotonate tautomerase  52.42 
 
 
139 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398281  normal  0.0590497 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1736  4-oxalocrotonate tautomerase  53.91 
 
 
127 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1663  4-oxalocrotonate tautomerase  53.12 
 
 
127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0155634  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0302  4-oxalocrotonate tautomerase  47.2 
 
 
131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2211  4-oxalocrotonate tautomerase  52.34 
 
 
127 aa  126  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00393274  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0880  4-oxalocrotonate tautomerase  50.4 
 
 
126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3399  4-oxalocrotonate tautomerase  49.6 
 
 
127 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2646  acyloate catabolism-like protein  43.65 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.391983  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1896  4-oxalocrotonate tautomerase  37.7 
 
 
136 aa  96.7  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2961  4-oxalocrotonate tautomerase  37.19 
 
 
134 aa  90.5  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0936  4-oxalocrotonate tautomerase  40.8 
 
 
134 aa  90.1  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4228  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 
131 aa  88.6  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1460  putative tautomerase  36.59 
 
 
144 aa  88.2  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0162  4-oxalocrotonate tautomerase  35.48 
 
 
130 aa  87  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2106  4-oxalocrotonate tautomerase  35.2 
 
 
129 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501901 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2146  4-oxalocrotonate tautomerase  35.2 
 
 
129 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.232573  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5462  4-oxalocrotonate tautomerase  32.03 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0307831  normal  0.0551368 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.43 
 
 
244 aa  86.3  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2038  hypothetical protein  31.25 
 
 
132 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.247889  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2757  4-oxalocrotonate tautomerase  37.8 
 
 
130 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2423  4-oxalocrotonate tautomerase  35.2 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0210887 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2017  hypothetical protein  29.69 
 
 
135 aa  84  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.333097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1756  hypothetical protein  29.69 
 
 
135 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1974  hypothetical protein  29.69 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.213e-16 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1799  hypothetical protein  29.69 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1939  hypothetical protein  29.69 
 
 
135 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8518  4-oxalocrotonate tautomerase  32.8 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0609  tautomerase  35.54 
 
 
129 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1751  4-oxalocrotonate tautomerase  29.01 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00944027  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7514  4-oxalocrotonate tautomerase  34.4 
 
 
143 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3857  4-oxalocrotonate tautomerase  30.4 
 
 
129 aa  76.6  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00692492  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5129  4-oxalocrotonate tautomerase  29.84 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741439  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4134  4-oxalocrotonate tautomerase  33.61 
 
 
272 aa  73.9  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1817  4-oxalocrotonate tautomerase  32 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200141 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6826  4-oxalocrotonate tautomerase  29.6 
 
 
129 aa  67  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.683318 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6040  4-oxalocrotonate tautomerase  30.43 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.868812  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2286  4-oxalocrotonate tautomerase  36.54 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1717  hypothetical protein  29.51 
 
 
129 aa  54.7  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2409  hypothetical protein  26.89 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125635  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0810  hypothetical protein  29.03 
 
 
131 aa  51.6  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2075  4-oxalocrotonate tautomerase  27.45 
 
 
127 aa  47  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.356466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>