67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2146 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2146  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
129 aa  267  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.232573  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2423  4-oxalocrotonate tautomerase  98.45 
 
 
129 aa  264  4e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0210887 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2106  4-oxalocrotonate tautomerase  96.9 
 
 
129 aa  260  4.999999999999999e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501901 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8518  4-oxalocrotonate tautomerase  72.09 
 
 
129 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1817  4-oxalocrotonate tautomerase  69.77 
 
 
129 aa  184  3e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200141 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7514  4-oxalocrotonate tautomerase  58.91 
 
 
143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3857  4-oxalocrotonate tautomerase  57.36 
 
 
129 aa  160  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00692492  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6826  4-oxalocrotonate tautomerase  52.71 
 
 
129 aa  144  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.683318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2757  4-oxalocrotonate tautomerase  51.54 
 
 
130 aa  142  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4228  4-oxalocrotonate tautomerase  48.46 
 
 
131 aa  130  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0936  4-oxalocrotonate tautomerase  43.08 
 
 
134 aa  113  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3113  4-oxalocrotonate tautomerase  45.24 
 
 
126 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0302  4-oxalocrotonate tautomerase  33.08 
 
 
131 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4890  4-oxalocrotonate tautomerase  39.2 
 
 
127 aa  94.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100984  hitchhiker  0.0008433 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2018  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.651181 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5129  4-oxalocrotonate tautomerase  36.89 
 
 
130 aa  92  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741439  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3285  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1736  4-oxalocrotonate tautomerase  39.84 
 
 
127 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3211  4-oxalocrotonate tautomerase  37.3 
 
 
126 aa  91.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00825864 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3752  4-oxalocrotonate tautomerase  37.6 
 
 
127 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317279  normal  0.179922 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3223  4-oxalocrotonate tautomerase  37.6 
 
 
127 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858973  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1663  4-oxalocrotonate tautomerase  39.06 
 
 
127 aa  90.1  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0155634  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2211  4-oxalocrotonate tautomerase  39.06 
 
 
127 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00393274  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2241  4-oxalocrotonate tautomerase  36.8 
 
 
127 aa  89.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280838  normal  0.0465075 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3586  4-oxalocrotonate tautomerase  38.71 
 
 
139 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398281  normal  0.0590497 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1460  putative tautomerase  34.88 
 
 
144 aa  88.2  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0880  4-oxalocrotonate tautomerase  38.28 
 
 
126 aa  87.4  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4561  4-oxalocrotonate tautomerase  34.65 
 
 
127 aa  87.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0161169  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0162  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 
130 aa  87.4  7e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0588  tautomerase enzyme family protein  37.8 
 
 
127 aa  86.3  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3672  4-oxalocrotonate tautomerase  35.2 
 
 
127 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3855  4-oxalocrotonate tautomerase  35.2 
 
 
127 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243179  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4509  4-oxalocrotonate tautomerase  35.2 
 
 
127 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0981308  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4181  4-oxalocrotonate tautomerase  35.2 
 
 
126 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.668909  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2767  4-oxalocrotonate tautomerase  32.54 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2435  4-oxalocrotonate tautomerase  37.8 
 
 
127 aa  84.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119976  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0292  tautomerase enzyme family protein  37.8 
 
 
127 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0873  tautomerase enzyme family protein  37.8 
 
 
127 aa  84.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0509  4-oxalocrotonate tautomerase  35.2 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.380197  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1472  4-oxalocrotonate tautomerase  37.8 
 
 
127 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.329573  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1669  4-oxalocrotonate tautomerase  37.8 
 
 
127 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0324  4-oxalocrotonate tautomerase  37.8 
 
 
127 aa  84.7  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2571  tautomerase enzyme family protein  37.8 
 
 
127 aa  84.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2853  hypothetical protein  31.2 
 
 
127 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5441  hypothetical protein  35.2 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4401  4-oxalocrotonate tautomerase  32.8 
 
 
127 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.037596 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0609  tautomerase  32.31 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4668  4-oxalocrotonate tautomerase  34.13 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744907  normal  0.547814 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0949  4-oxalocrotonate tautomerase  31.4 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1896  4-oxalocrotonate tautomerase  31.4 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2961  4-oxalocrotonate tautomerase  30.08 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3399  4-oxalocrotonate tautomerase  28.35 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2646  acyloate catabolism-like protein  29.37 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.391983  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1751  4-oxalocrotonate tautomerase  26.79 
 
 
137 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00944027  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5462  4-oxalocrotonate tautomerase  24.43 
 
 
139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0307831  normal  0.0551368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4134  4-oxalocrotonate tautomerase  31.4 
 
 
272 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1756  hypothetical protein  24.62 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2017  hypothetical protein  24.62 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.333097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1799  hypothetical protein  25.95 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1974  hypothetical protein  25.95 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.213e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1939  hypothetical protein  25.95 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2038  hypothetical protein  25.38 
 
 
132 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.247889  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  23.48 
 
 
244 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0810  hypothetical protein  27.87 
 
 
131 aa  47  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2409  hypothetical protein  24.17 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125635  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0819  4-oxalocrotonate tautomerase  35 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2075  4-oxalocrotonate tautomerase  27.27 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.356466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>