70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2961 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2961  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
134 aa  278  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4890  4-oxalocrotonate tautomerase  38.02 
 
 
127 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100984  hitchhiker  0.0008433 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2241  4-oxalocrotonate tautomerase  38.84 
 
 
127 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280838  normal  0.0465075 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3855  4-oxalocrotonate tautomerase  37.19 
 
 
127 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243179  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3672  4-oxalocrotonate tautomerase  37.19 
 
 
127 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4509  4-oxalocrotonate tautomerase  37.19 
 
 
127 aa  90.5  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0981308  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0302  4-oxalocrotonate tautomerase  35.54 
 
 
131 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4561  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
127 aa  88.6  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0161169  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0588  tautomerase enzyme family protein  37.19 
 
 
127 aa  87.8  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2767  4-oxalocrotonate tautomerase  38.84 
 
 
126 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3752  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
127 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317279  normal  0.179922 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3223  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
127 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858973  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0949  4-oxalocrotonate tautomerase  35.54 
 
 
124 aa  87.4  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3113  4-oxalocrotonate tautomerase  36.36 
 
 
126 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4401  4-oxalocrotonate tautomerase  33.88 
 
 
127 aa  84  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.037596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0509  4-oxalocrotonate tautomerase  34.71 
 
 
126 aa  83.6  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.380197  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2435  4-oxalocrotonate tautomerase  35.54 
 
 
127 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119976  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0324  4-oxalocrotonate tautomerase  35.54 
 
 
127 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2571  tautomerase enzyme family protein  35.54 
 
 
127 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1669  4-oxalocrotonate tautomerase  35.54 
 
 
127 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0880  4-oxalocrotonate tautomerase  35.25 
 
 
126 aa  83.6  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0873  tautomerase enzyme family protein  35.54 
 
 
127 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0292  tautomerase enzyme family protein  35.54 
 
 
127 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1472  4-oxalocrotonate tautomerase  35.54 
 
 
127 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.329573  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3211  4-oxalocrotonate tautomerase  31.4 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00825864 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4181  4-oxalocrotonate tautomerase  34.71 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.668909  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2853  hypothetical protein  31.4 
 
 
127 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5462  4-oxalocrotonate tautomerase  28.36 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0307831  normal  0.0551368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5441  hypothetical protein  32.23 
 
 
125 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4668  4-oxalocrotonate tautomerase  31.97 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744907  normal  0.547814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3285  4-oxalocrotonate tautomerase  34.71 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0936  4-oxalocrotonate tautomerase  36.07 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3586  4-oxalocrotonate tautomerase  35.54 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398281  normal  0.0590497 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1751  4-oxalocrotonate tautomerase  27.61 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00944027  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2646  acyloate catabolism-like protein  32.54 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.391983  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1799  hypothetical protein  29.6 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1974  hypothetical protein  29.6 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.213e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1939  hypothetical protein  29.6 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4134  4-oxalocrotonate tautomerase  34.71 
 
 
272 aa  73.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2018  4-oxalocrotonate tautomerase  29.75 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.651181 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2038  hypothetical protein  28.8 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.247889  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3399  4-oxalocrotonate tautomerase  30.58 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1736  4-oxalocrotonate tautomerase  33.06 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2757  4-oxalocrotonate tautomerase  28.46 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1756  hypothetical protein  27.82 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2017  hypothetical protein  27.07 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.333097  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1663  4-oxalocrotonate tautomerase  33.06 
 
 
127 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0155634  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1460  putative tautomerase  31.2 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0162  4-oxalocrotonate tautomerase  29.51 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  25.6 
 
 
244 aa  70.5  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2146  4-oxalocrotonate tautomerase  30.08 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.232573  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2211  4-oxalocrotonate tautomerase  32.23 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00393274  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8518  4-oxalocrotonate tautomerase  28.69 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2106  4-oxalocrotonate tautomerase  30.08 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501901 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2423  4-oxalocrotonate tautomerase  30.08 
 
 
129 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0210887 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7514  4-oxalocrotonate tautomerase  29.51 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6826  4-oxalocrotonate tautomerase  28.1 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.683318 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2409  hypothetical protein  28.21 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125635  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1896  4-oxalocrotonate tautomerase  28.93 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5129  4-oxalocrotonate tautomerase  31.45 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741439  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1817  4-oxalocrotonate tautomerase  29.51 
 
 
129 aa  63.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200141 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4228  4-oxalocrotonate tautomerase  27.05 
 
 
131 aa  61.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0609  tautomerase  23.77 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3066  transglutaminase-like  34.41 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3857  4-oxalocrotonate tautomerase  22.31 
 
 
129 aa  51.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00692492  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1081  transglutaminase-like  29.41 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6040  4-oxalocrotonate tautomerase  25 
 
 
137 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.868812  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1002  transglutaminase-like  26.47 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00906021  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2138  4-oxalocrotonate tautomerase  28.57 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2075  4-oxalocrotonate tautomerase  27.73 
 
 
127 aa  40.4  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.356466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>