67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4228 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4228  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 131 aa  263  5e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2757  4-oxalocrotonate tautomerase  66.15 
 
 		 130 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2106  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501901 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2146  4-oxalocrotonate tautomerase  48.46 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.232573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2423  4-oxalocrotonate tautomerase  48.46 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0210887 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1817  4-oxalocrotonate tautomerase  48.46 
 
 		 129 aa  123  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.200141 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0936  4-oxalocrotonate tautomerase  48.48 
 
 		 134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7514  4-oxalocrotonate tautomerase  39.23 
 
 		 143 aa  114  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8518  4-oxalocrotonate tautomerase  42.31 
 
 		 129 aa  111  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6826  4-oxalocrotonate tautomerase  41.54 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.683318 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3857  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 129 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00692492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0880  4-oxalocrotonate tautomerase  42.52 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4668  4-oxalocrotonate tautomerase  39.68 
 
 		 127 aa  97.4  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744907  normal  0.547814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0302  4-oxalocrotonate tautomerase  38.58 
 
 		 131 aa  97.1  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3211  4-oxalocrotonate tautomerase  40.48 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00825864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3285  4-oxalocrotonate tautomerase  40.62 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3113  4-oxalocrotonate tautomerase  39.68 
 
 		 126 aa  94.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2018  4-oxalocrotonate tautomerase  37.3 
 
 		 126 aa  92.8  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.651181 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3586  4-oxalocrotonate tautomerase  41.41 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398281  normal  0.0590497 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2853  hypothetical protein  36.22 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3672  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 		 127 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4509  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 		 127 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0981308  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1663  4-oxalocrotonate tautomerase  39.68 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0155634  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3855  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 		 127 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2211  4-oxalocrotonate tautomerase  39.68 
 
 		 127 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00393274  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2241  4-oxalocrotonate tautomerase  38.1 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280838  normal  0.0465075 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4890  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100984  hitchhiker  0.0008433 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1736  4-oxalocrotonate tautomerase  38.89 
 
 		 127 aa  87  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1472  4-oxalocrotonate tautomerase  37.8 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.329573  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1669  4-oxalocrotonate tautomerase  37.8 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2571  tautomerase enzyme family protein  37.8 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2435  4-oxalocrotonate tautomerase  37.8 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119976  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0324  4-oxalocrotonate tautomerase  37.8 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0873  tautomerase enzyme family protein  37.8 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0292  tautomerase enzyme family protein  37.8 
 
 		 127 aa  84.3  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1799  hypothetical protein  26.15 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1974  hypothetical protein  26.15 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.213e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1939  hypothetical protein  26.15 
 
 		 135 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0509  4-oxalocrotonate tautomerase  36.51 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.380197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3752  4-oxalocrotonate tautomerase  34.92 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317279  normal  0.179922 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3223  4-oxalocrotonate tautomerase  34.92 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858973  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1756  hypothetical protein  25.38 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448387  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4181  4-oxalocrotonate tautomerase  35.71 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.668909  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2017  hypothetical protein  25.38 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.333097  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5462  4-oxalocrotonate tautomerase  25.19 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0307831  normal  0.0551368 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5129  4-oxalocrotonate tautomerase  32.81 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0588  tautomerase enzyme family protein  37.01 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2038  hypothetical protein  25.38 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.247889  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4561  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0161169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2767  4-oxalocrotonate tautomerase  33.07 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3399  4-oxalocrotonate tautomerase  30.23 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1751  4-oxalocrotonate tautomerase  24.43 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00944027  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5441  hypothetical protein  38.28 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2646  acyloate catabolism-like protein  32.28 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.391983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4401  4-oxalocrotonate tautomerase  29.37 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.037596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0949  4-oxalocrotonate tautomerase  34.4 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0609  tautomerase  31.15 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0162  4-oxalocrotonate tautomerase  30.23 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1460  putative tautomerase  28.68 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2961  4-oxalocrotonate tautomerase  27.05 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.858705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2660  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.15 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2409  hypothetical protein  28.1 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.125635  normal  0.492262 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1896  4-oxalocrotonate tautomerase  29.46 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6040  4-oxalocrotonate tautomerase  27.87 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.868812  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0819  4-oxalocrotonate tautomerase  40 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4134  4-oxalocrotonate tautomerase  27.64 
 
 		 272 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1081  transglutaminase-like  27 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>