115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3756 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3756  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 		 413 aa  782    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0103395  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5571  phosphoesterase PA-phosphatase related  52.1 
 
 		 194 aa  153  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0212028  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5310  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.36 
 
 		 193 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2302  undecaprenyl-diphosphatase  34.39 
 
 		 198 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0329853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5144  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.99 
 
 		 193 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.418919  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5715  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.99 
 
 		 193 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.134003 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4524  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.99 
 
 		 193 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3165  undecaprenyl-diphosphatase  36.52 
 
 		 193 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3127  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.62 
 
 		 193 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634869  normal  0.862887 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4984  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.07 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3000  PA-phosphatase-like phosphoesterase  35.88 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.30971 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4035  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase (Tn6048)  35.88 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase (Tn6048)  35.88 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7181  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.75 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.495224 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0021  PAP2 family protein  33.15 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0690  undecaprenyl-diphosphatase  30.13 
 
 		 198 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0272  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  26.01 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0019  PAP2 family protein  32.58 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1449  PAP2 family protein  32.58 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0023  PAP2 family protein  32.58 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1169  PAP2 family protein  32.58 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0023  PAP2 family protein  32.58 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0025  PAP2 family protein  32.02 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0343161  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1526  PAP2 family protein  32.02 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0055  undecaprenyl-diphosphatase  39.32 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4126  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.58 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1924  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.12 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00808  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.75 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2801  Undecaprenyl-diphosphatase  29.75 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185163  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00825  hypothetical protein  29.75 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0902  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.75 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0843231  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2801  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.75 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.907509 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0868  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.11 
 
 		 198 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0994  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.75 
 
 		 198 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485972  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0931  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.8 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.11 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1713  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.5 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.118972  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.11 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3142  putative transport transmembrane protein  31.33 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.895502 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1634  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.11 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.550126  decreased coverage  0.000150878 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.9 
 
 		 201 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1557  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.9 
 
 		 201 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2736  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.9 
 
 		 201 aa  59.3  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37805  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3422  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.77 
 
 		 199 aa  59.7  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.631803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3076  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.47 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0399  phosphatase  30.08 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.556092  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.8 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.130415 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3283  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.44 
 
 		 189 aa  57  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.038205  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2489  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.08 
 
 		 199 aa  57  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0315773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2678  Pap2 superfamily protein, putative  34.91 
 
 		 199 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129761  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0937  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.57 
 
 		 224 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0998  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.57 
 
 		 202 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1017  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.57 
 
 		 224 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0729132  normal  0.570341 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0969  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.57 
 
 		 202 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1745  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.07 
 
 		 200 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000013201  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2794  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.67 
 
 		 199 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.755209  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0901  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.57 
 
 		 224 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2194  PAP2 family phosphatase  23.75 
 
 		 183 aa  53.5  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000351549  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0495  PAP2 superfamily protein  28.32 
 
 		 195 aa  53.5  0.000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2635  bacitracin transport permease protein bcrc  30.34 
 
 		 199 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183943 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2151  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.04 
 
 		 200 aa  53.1  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2053  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.5 
 
 		 199 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.400178  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2759  bacitracin transport permease protein bcrc  38.81 
 
 		 199 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0828321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2329  PAP2 family protein  24.55 
 
 		 211 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.401849  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2497  bacitracin transport permease  41.79 
 
 		 199 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202307  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2508  PAP2 family protein  24.55 
 
 		 211 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1131  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.82 
 
 		 198 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2676  bacitracin transport permease protein bcrc  25.82 
 
 		 199 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2391  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  27.78 
 
 		 199 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2716  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  27.78 
 
 		 199 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.179676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2523  PAP2 family protein  26.76 
 
 		 181 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000225597 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2665  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  27.78 
 
 		 199 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160204 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2430  PAP2 family protein  27.78 
 
 		 199 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000481219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2785  bacitracin transport permease  38.81 
 
 		 199 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.74 
 
 		 194 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2292  phosphatase, PAP2 family protein  24.55 
 
 		 194 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000588398  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0422  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.93 
 
 		 192 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.96 
 
 		 205 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2366  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 201 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0167377 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0463  Undecaprenyl-diphosphatase  32.08 
 
 		 219 aa  48.5  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.282936  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2462  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  40.3 
 
 		 199 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0841769  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1234  diacylglycerol kinase  44.29 
 
 		 235 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.89 
 
 		 169 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0828  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.87 
 
 		 252 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4605  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.75 
 
 		 249 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15070  PAP2 superfamily protein  36.36 
 
 		 198 aa  47.4  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.872818 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.16 
 
 		 178 aa  47  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1940  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.21 
 
 		 207 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4580  phosphoesterase, PA-phosphatase related protein  41.11 
 
 		 197 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2905  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.15 
 
 		 255 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.19 
 
 		 182 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  34.48 
 
 		 359 aa  45.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  34.48 
 
 		 359 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3290  phosphoesterase PA-phosphatase related  46.03 
 
 		 171 aa  44.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3250  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.87 
 
 		 267 aa  44.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3446  phosphoesterase PA-phosphatase related  32 
 
 		 267 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1410  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.29 
 
 		 187 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.163391 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0036  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.32 
 
 		 273 aa  44.3  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0425  undecaprenyl-diphosphatase  33.66 
 
 		 203 aa  44.3  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3095  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 		 255 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>