121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3283 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3283  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 		 189 aa  361  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.038205  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0931  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.36 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4580  phosphoesterase, PA-phosphatase related protein  39.26 
 
 		 197 aa  88.2  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0994  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.8 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485972  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.74 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.130415 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0868  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.28 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.28 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.28 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8629  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00808  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.75 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2801  Undecaprenyl-diphosphatase  31.75 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185163  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0902  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.75 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0843231  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2801  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.75 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.907509 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00825  hypothetical protein  31.75 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1634  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.95 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.550126  decreased coverage  0.000150878 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0901  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.05 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0937  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.05 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0998  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.05 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0969  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.05 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0055  undecaprenyl-diphosphatase  30.95 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1017  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.53 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0729132  normal  0.570341 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0021  PAP2 family protein  31.48 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0690  undecaprenyl-diphosphatase  30.57 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7181  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.52 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.495224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2302  undecaprenyl-diphosphatase  32.93 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0329853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2151  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.29 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3076  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.67 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4126  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.8 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0025  PAP2 family protein  31.34 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0343161  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1526  PAP2 family protein  31.9 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1169  PAP2 family protein  31.9 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0023  PAP2 family protein  31.9 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0019  PAP2 family protein  31.9 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1449  PAP2 family protein  31.9 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0023  PAP2 family protein  31.9 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.4 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1557  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.4 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2736  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.4 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37805  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3756  phosphoesterase PA-phosphatase related  45.71 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0103395  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3422  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.11 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.631803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5571  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.63 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0212028  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1745  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.47 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000013201  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3000  PA-phosphatase-like phosphoesterase  27.91 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.30971 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4035  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase (Tn6048)  27.91 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase (Tn6048)  27.91 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1842  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.46 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5144  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.1 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.418919  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5715  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.1 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.134003 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4524  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.1 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0272  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  25.15 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5310  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.29 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3165  undecaprenyl-diphosphatase  30.43 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2128  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.66 
 
 		 199 aa  50.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.167938  normal  0.900368 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0373  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.48 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2317  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.12 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.29 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4984  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.86 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0495  PAP2 superfamily protein  28.65 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3127  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.29 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634869  normal  0.862887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2382  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.93 
 
 		 221 aa  48.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000279179  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  31.82 
 
 		 986 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2143  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.13 
 
 		 202 aa  48.1  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.100346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2918  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.36 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.3 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2011  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.45 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.235686  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1778  phosphoesterase, PA-phosphatase related  23.16 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0038  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.66 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2631  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.78 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6467  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.08 
 
 		 232 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.555163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0006  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.98 
 
 		 293 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3142  putative transport transmembrane protein  32.04 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.895502 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2672  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  26.32 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2178  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.48 
 
 		 166 aa  46.2  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  23.73 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1713  phosphoesterase PA-phosphatase related  32 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.118972  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2395  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.86 
 
 		 465 aa  45.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1598  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.85 
 
 		 180 aa  45.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.970961  hitchhiker  0.00000195096 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2430  PAP2 family protein  27.94 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000481219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2444  hypothetical protein  39.56 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0113795  normal  0.0207864 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2489  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.78 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0315773  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2635  bacitracin transport permease protein bcrc  28.87 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183943 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  43.94 
 
 		 357 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2391  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  27.94 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2665  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  27.94 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160204 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1410  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.47 
 
 		 187 aa  45.1  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.163391 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0399  phosphatase  30.67 
 
 		 187 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.556092  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2748  phosphoesterase, PA-phosphatase-related protein  42.37 
 
 		 248 aa  44.7  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.572696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1102  phosphatase  28.38 
 
 		 185 aa  44.7  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0240643  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2678  Pap2 superfamily protein, putative  29.85 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129761  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  46.55 
 
 		 201 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  46.55 
 
 		 201 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  30.11 
 
 		 358 aa  44.7  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2366  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.01 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0167377 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  23.85 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1525  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.51 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2716  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  27.94 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.179676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3490  phosphoesterase PA-phosphatase related  47.95 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2194  PAP2 family phosphatase  29.33 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000351549  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0468  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.05 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3368  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.53 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5915  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.85 
 
 		 249 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.322864  normal  0.445191 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>