143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5571 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_5571  phosphoesterase PA-phosphatase related  100 
 
 
194 aa  371  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0212028  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3756  phosphoesterase PA-phosphatase related  51.68 
 
 
413 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0103395  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3142  putative transport transmembrane protein  36 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.895502 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2302  undecaprenyl-diphosphatase  34.66 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0329853  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1634  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.08 
 
 
201 aa  79.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.550126  decreased coverage  0.000150878 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00808  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.72 
 
 
198 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2801  Undecaprenyl-diphosphatase  33.72 
 
 
198 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185163  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00825  hypothetical protein  33.72 
 
 
198 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0902  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.72 
 
 
198 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0843231  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2801  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.72 
 
 
198 aa  77.8  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.907509 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.75 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.75 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8629  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0994  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.75 
 
 
198 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485972  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0868  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.75 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0272  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.57 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7181  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.36 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.495224 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0690  undecaprenyl-diphosphatase  32.08 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1017  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.15 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0729132  normal  0.570341 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.84 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.130415 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.44 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1557  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.44 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2736  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.44 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37805  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3000  PA-phosphatase-like phosphoesterase  32.3 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.30971 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4035  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase (Tn6048)  32.3 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase (Tn6048)  32.3 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0937  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.58 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0998  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.58 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51948  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0901  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.58 
 
 
224 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0969  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  32.58 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0021  PAP2 family protein  36.69 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3422  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.11 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.631803  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0055  undecaprenyl-diphosphatase  33.94 
 
 
200 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3076  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.11 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4126  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.52 
 
 
200 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1924  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.21 
 
 
180 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5310  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.73 
 
 
193 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0019  PAP2 family protein  36.09 
 
 
198 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1449  PAP2 family protein  36.09 
 
 
198 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0025  PAP2 family protein  36.09 
 
 
198 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0343161  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0023  PAP2 family protein  36.09 
 
 
198 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3165  undecaprenyl-diphosphatase  33.53 
 
 
193 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0399  phosphatase  29.08 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.556092  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1526  PAP2 family protein  36.09 
 
 
211 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1169  PAP2 family protein  36.09 
 
 
211 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0023  PAP2 family protein  36.09 
 
 
211 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2489  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.3 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0315773  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3127  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.12 
 
 
193 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634869  normal  0.862887 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4984  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.12 
 
 
193 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2635  bacitracin transport permease protein bcrc  24.85 
 
 
199 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183943 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  47.13 
 
 
205 aa  58.5  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2391  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  31.01 
 
 
199 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193299  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5144  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.42 
 
 
193 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.418919  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5715  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.42 
 
 
193 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.134003 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4524  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.42 
 
 
193 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2665  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  31.01 
 
 
199 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160204 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2678  Pap2 superfamily protein, putative  25.9 
 
 
199 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129761  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2676  bacitracin transport permease protein bcrc  25.32 
 
 
199 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2151  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.57 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1745  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.32 
 
 
200 aa  56.6  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000013201  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0931  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.24 
 
 
189 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1713  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.33 
 
 
176 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.118972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2194  PAP2 family phosphatase  32.43 
 
 
183 aa  55.1  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000351549  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2492  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.83 
 
 
425 aa  55.1  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0495  PAP2 superfamily protein  28.8 
 
 
195 aa  55.1  0.0000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2716  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  29.75 
 
 
199 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.179676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2329  PAP2 family protein  32.77 
 
 
211 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.401849  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2430  PAP2 family protein  28.8 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000481219  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2508  PAP2 family protein  32.77 
 
 
211 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2523  PAP2 family protein  30.66 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000225597 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1456  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.16 
 
 
192 aa  52.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4143  phosphoesterase PA-phosphatase related  35 
 
 
201 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4117  phosphoesterase PA-phosphatase related  35 
 
 
201 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15070  PAP2 superfamily protein  33.8 
 
 
198 aa  52.4  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.872818 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2292  phosphatase, PAP2 family protein  35.24 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000588398  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3283  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.05 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.038205  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0465  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.68 
 
 
199 aa  50.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451199  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09156  hypothetical protein  30.23 
 
 
187 aa  49.7  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.63816  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.91 
 
 
169 aa  49.7  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.86 
 
 
174 aa  49.3  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0315  membrane-associated phospholipid phosphatase  30.3 
 
 
216 aa  48.5  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.770739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2462  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  29.32 
 
 
199 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0841769  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2382  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.93 
 
 
221 aa  48.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000279179  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1480  undecaprenyl-diphosphatase  37.35 
 
 
180 aa  48.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00409552  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2497  bacitracin transport permease  29.23 
 
 
199 aa  47.8  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202307  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  31.91 
 
 
358 aa  47.8  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1011  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.18 
 
 
217 aa  47.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.943443  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00821  phospholipid phosphatase  41.84 
 
 
182 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2794  phosphoesterase PA-phosphatase related  24.38 
 
 
199 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.755209  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0315  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.87 
 
 
378 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.25 
 
 
194 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4580  phosphoesterase, PA-phosphatase related protein  40.48 
 
 
197 aa  46.6  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2395  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.05 
 
 
465 aa  45.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0463  Undecaprenyl-diphosphatase  29.17 
 
 
219 aa  45.8  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.282936  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0468  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.11 
 
 
200 aa  45.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.21 
 
 
178 aa  45.8  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001653  membrane-associated phospholipid phosphatase  42.35 
 
 
182 aa  45.4  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02460  PAP2 superfamily protein  35.61 
 
 
188 aa  45.1  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.457854  normal  0.122911 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2536  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  26.32 
 
 
431 aa  45.1  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0666  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  47.06 
 
 
160 aa  45.1  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2222  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.82 
 
 
447 aa  45.1  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>