105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1745 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_1745  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
200 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000013201  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2151  phosphoesterase PA-phosphatase related  62.5 
 
 
200 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0055  undecaprenyl-diphosphatase  56.5 
 
 
200 aa  228  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7181  phosphoesterase PA-phosphatase related  54.27 
 
 
200 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.495224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4126  phosphoesterase PA-phosphatase related  53.54 
 
 
200 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0690  undecaprenyl-diphosphatase  46.46 
 
 
198 aa  154  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2302  undecaprenyl-diphosphatase  43.65 
 
 
198 aa  149  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0329853  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1634  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.5 
 
 
201 aa  149  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.550126  decreased coverage  0.000150878 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3000  PA-phosphatase-like phosphoesterase  42.21 
 
 
198 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.30971 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4035  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase (Tn6048)  42.21 
 
 
198 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase (Tn6048)  42.21 
 
 
198 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0998  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.69 
 
 
202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51948  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0901  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.69 
 
 
224 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0969  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.69 
 
 
202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0937  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.69 
 
 
224 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1017  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.19 
 
 
224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0729132  normal  0.570341 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00808  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.44 
 
 
198 aa  135  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2801  Undecaprenyl-diphosphatase  37.44 
 
 
198 aa  135  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185163  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0902  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.44 
 
 
198 aa  135  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0843231  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2801  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.44 
 
 
198 aa  135  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.907509 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00825  hypothetical protein  37.44 
 
 
198 aa  135  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.68 
 
 
202 aa  134  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.130415 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3076  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.24 
 
 
199 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.44 
 
 
198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.44 
 
 
198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8629  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0994  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.44 
 
 
198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485972  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0868  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.44 
 
 
198 aa  132  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3422  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.75 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.631803  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3142  putative transport transmembrane protein  40.2 
 
 
199 aa  118  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.895502 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5310  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.92 
 
 
193 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0021  PAP2 family protein  37.89 
 
 
220 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3165  undecaprenyl-diphosphatase  39.9 
 
 
193 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4984  phosphoesterase, PA-phosphatase related  38.86 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3127  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.34 
 
 
193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634869  normal  0.862887 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5144  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.41 
 
 
193 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.418919  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5715  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.41 
 
 
193 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.134003 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4524  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.41 
 
 
193 aa  109  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1526  PAP2 family protein  37.89 
 
 
211 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1169  PAP2 family protein  37.89 
 
 
211 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0023  PAP2 family protein  37.89 
 
 
211 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0019  PAP2 family protein  38.5 
 
 
198 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1449  PAP2 family protein  38.5 
 
 
198 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0025  PAP2 family protein  38.5 
 
 
198 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0343161  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0023  PAP2 family protein  38.5 
 
 
198 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.32 
 
 
201 aa  104  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1557  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.32 
 
 
201 aa  104  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2736  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.32 
 
 
201 aa  104  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37805  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0272  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.84 
 
 
188 aa  97.4  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0495  PAP2 superfamily protein  32.86 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1924  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.75 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2678  Pap2 superfamily protein, putative  31.61 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129761  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2635  bacitracin transport permease protein bcrc  33.12 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183943 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2391  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  29.3 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2489  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.87 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0315773  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2665  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  29.3 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160204 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2676  bacitracin transport permease protein bcrc  30.32 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2716  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  29.3 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.179676  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0931  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.56 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2631  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.77 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2430  PAP2 family protein  28.66 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000481219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2785  bacitracin transport permease  28.87 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5571  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.67 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0212028  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1713  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.52 
 
 
176 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.118972  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3725  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.85 
 
 
158 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2794  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.52 
 
 
199 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.755209  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1480  undecaprenyl-diphosphatase  31.78 
 
 
180 aa  58.9  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00409552  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2497  bacitracin transport permease  26.8 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202307  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1553  undecaprenyl-diphosphatase  33.33 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0666  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.11 
 
 
160 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2462  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  27.51 
 
 
199 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0841769  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2059  undecaprenyl-diphosphatase  31.82 
 
 
204 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0523127  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2053  phosphoesterase PA-phosphatase related  24.48 
 
 
199 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.400178  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1456  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  29.03 
 
 
192 aa  55.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2759  bacitracin transport permease protein bcrc  25.41 
 
 
199 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0828321  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1173  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.6 
 
 
183 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0920806  normal  0.0722851 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0399  phosphatase  25.83 
 
 
187 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.556092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2329  PAP2 family protein  28.31 
 
 
211 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.401849  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2508  PAP2 family protein  28.31 
 
 
211 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2523  PAP2 family protein  28.31 
 
 
181 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000225597 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2382  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.47 
 
 
221 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000279179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2194  PAP2 family phosphatase  26.97 
 
 
183 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000351549  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3756  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.1 
 
 
413 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0103395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2292  phosphatase, PAP2 family protein  25.31 
 
 
194 aa  48.5  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000588398  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2248  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  23.85 
 
 
182 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4580  phosphoesterase, PA-phosphatase related protein  33.33 
 
 
197 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1888  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.78 
 
 
192 aa  47  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.871384  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5027  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.39 
 
 
255 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.223489  normal  0.43198 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0463  Undecaprenyl-diphosphatase  24.35 
 
 
219 aa  45.8  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.282936  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.95 
 
 
182 aa  45.1  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  28.57 
 
 
358 aa  45.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  26.85 
 
 
364 aa  44.7  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3283  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.94 
 
 
189 aa  44.7  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.038205  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1778  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25 
 
 
182 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.03 
 
 
178 aa  44.3  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1011  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.04 
 
 
217 aa  43.5  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.943443  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.43 
 
 
194 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0231  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.12 
 
 
238 aa  42.4  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11150  phosphoesterase PA-phosphatase related  33 
 
 
176 aa  42.7  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0795  PAP2 family protein  24.14 
 
 
193 aa  42  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0176796  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0315  membrane-associated phospholipid phosphatase  25.49 
 
 
216 aa  42  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.770739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>