122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3142 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc3142  putative transport transmembrane protein  100 
 
 
199 aa  381  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.895502 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3076  phosphoesterase PA-phosphatase related  80.9 
 
 
199 aa  301  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3422  phosphoesterase PA-phosphatase related  80.4 
 
 
199 aa  301  5.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.631803  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2302  undecaprenyl-diphosphatase  56.78 
 
 
198 aa  208  5e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0329853  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3000  PA-phosphatase-like phosphoesterase  56.28 
 
 
198 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.30971 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4035  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase (Tn6048)  56.28 
 
 
198 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase (Tn6048)  56.28 
 
 
198 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0690  undecaprenyl-diphosphatase  51.76 
 
 
198 aa  188  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7181  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.12 
 
 
200 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.495224 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5310  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.39 
 
 
193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0055  undecaprenyl-diphosphatase  42.21 
 
 
200 aa  134  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4126  phosphoesterase PA-phosphatase related  48.03 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4984  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.21 
 
 
193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3127  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.21 
 
 
193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634869  normal  0.862887 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5144  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.74 
 
 
193 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.418919  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5715  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40.74 
 
 
193 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.134003 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4524  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.74 
 
 
193 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0021  PAP2 family protein  39.58 
 
 
220 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3165  undecaprenyl-diphosphatase  39.15 
 
 
193 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1745  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.18 
 
 
200 aa  122  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000013201  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0901  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.64 
 
 
224 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0998  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.64 
 
 
202 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51948  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0969  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.64 
 
 
202 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0937  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.64 
 
 
224 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00808  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.12 
 
 
198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2801  Undecaprenyl-diphosphatase  38.12 
 
 
198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185163  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00825  hypothetical protein  38.12 
 
 
198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0902  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.12 
 
 
198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0843231  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2801  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.12 
 
 
198 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.907509 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1017  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.64 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0729132  normal  0.570341 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0994  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.62 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485972  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.13 
 
 
198 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.13 
 
 
198 aa  115  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0868  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.13 
 
 
198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1634  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.95 
 
 
201 aa  112  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.550126  decreased coverage  0.000150878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2151  phosphoesterase PA-phosphatase related  40 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1169  PAP2 family protein  38.34 
 
 
211 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0023  PAP2 family protein  38.34 
 
 
211 aa  111  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0019  PAP2 family protein  38.1 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1526  PAP2 family protein  38.34 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1449  PAP2 family protein  38.1 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0025  PAP2 family protein  38.1 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0343161  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0023  PAP2 family protein  38.1 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.66 
 
 
202 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.130415 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0272  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.21 
 
 
188 aa  95.9  3e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.98 
 
 
201 aa  95.9  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1557  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.98 
 
 
201 aa  95.9  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2736  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.98 
 
 
201 aa  95.9  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37805  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1924  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.26 
 
 
180 aa  91.7  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2759  bacitracin transport permease protein bcrc  35.19 
 
 
199 aa  85.1  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0828321  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2794  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.93 
 
 
199 aa  84.7  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.755209  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2716  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  29.26 
 
 
199 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.179676  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2676  bacitracin transport permease protein bcrc  31.25 
 
 
199 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2053  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.52 
 
 
199 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.400178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2391  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  28.72 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2665  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  28.72 
 
 
199 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160204 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2785  bacitracin transport permease  33.95 
 
 
199 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2678  Pap2 superfamily protein, putative  31.77 
 
 
199 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129761  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5571  phosphoesterase PA-phosphatase related  36 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0212028  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2489  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.79 
 
 
199 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0315773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2430  PAP2 family protein  28.19 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000481219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2497  bacitracin transport permease  34.52 
 
 
199 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2635  bacitracin transport permease protein bcrc  30.21 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183943 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2462  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  33.93 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0841769  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0495  PAP2 superfamily protein  28.3 
 
 
195 aa  74.3  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0399  phosphatase  31.01 
 
 
187 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.556092  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0931  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.05 
 
 
189 aa  72  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2194  PAP2 family phosphatase  31.01 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000351549  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1713  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.34 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.118972  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2329  PAP2 family protein  32 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.401849  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2508  PAP2 family protein  32 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2523  PAP2 family protein  32.21 
 
 
181 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000225597 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1480  undecaprenyl-diphosphatase  39.13 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00409552  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2292  phosphatase, PAP2 family protein  31.33 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000588398  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2631  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.23 
 
 
212 aa  63.9  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1131  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.45 
 
 
198 aa  58.9  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0666  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.73 
 
 
160 aa  58.9  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2248  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  29.93 
 
 
182 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1456  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.81 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3756  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.21 
 
 
413 aa  55.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0103395  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1173  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.99 
 
 
183 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0920806  normal  0.0722851 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3725  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.29 
 
 
158 aa  52.8  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1553  undecaprenyl-diphosphatase  33.97 
 
 
207 aa  52.4  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0918  hypothetical protein  39.13 
 
 
139 aa  51.2  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.75 
 
 
178 aa  51.2  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3283  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.038205  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5776  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.08 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00125534  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1041  hypothetical protein  39.13 
 
 
152 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  33.95 
 
 
359 aa  48.9  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  33.95 
 
 
359 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22000  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  40.54 
 
 
480 aa  48.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00559373  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0488  undecaprenyl-diphosphatase  34.65 
 
 
219 aa  48.1  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.263915 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0795  PAP2 family protein  29.05 
 
 
193 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0176796  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0783  PAP2 family protein  27.89 
 
 
193 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078196  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.17 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  31.98 
 
 
358 aa  45.1  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2222  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.82 
 
 
447 aa  45.1  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3773  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.86 
 
 
178 aa  44.7  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0882252 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3885  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.86 
 
 
178 aa  44.7  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3969  putative phosphatase  30.92 
 
 
423 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>