16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1041 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1041  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  313  4e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0918  hypothetical protein  94.4 
 
 		 139 aa  240  6e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2999  peptidase  66.67 
 
 		 111 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4034  Propeptide, PepSY amd peptidase M4 precursor (Tn6048)  66.67 
 
 		 111 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4983  Propeptide, PepSY amd peptidase M4 precursor (Tn6048)  66.67 
 
 		 111 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.582955  normal  0.339985 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3000  PA-phosphatase-like phosphoesterase  66.67 
 
 		 198 aa  87.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.30971 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4035  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase (Tn6048)  66.67 
 
 		 198 aa  87.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase (Tn6048)  66.67 
 
 		 198 aa  87.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2303  hypothetical protein  62.5 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0341031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2302  undecaprenyl-diphosphatase  56.52 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0329853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2504  propeptide, PepSY amd peptidase M4  57.14 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.637039 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2110  hypothetical protein  57.14 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0690  undecaprenyl-diphosphatase  49.25 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3422  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.3 
 
 		 199 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.631803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3076  phosphoesterase PA-phosphatase related  40.3 
 
 		 199 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3142  putative transport transmembrane protein  42.59 
 
 		 199 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.895502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>