134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4982 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_3000  PA-phosphatase-like phosphoesterase  100 
 
 
198 aa  387  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.30971 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4035  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase (Tn6048)  100 
 
 
198 aa  387  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase (Tn6048)  100 
 
 
198 aa  387  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2302  undecaprenyl-diphosphatase  68.69 
 
 
198 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0329853  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0690  undecaprenyl-diphosphatase  53.03 
 
 
198 aa  203  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3076  phosphoesterase PA-phosphatase related  54.77 
 
 
199 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3422  phosphoesterase PA-phosphatase related  54.77 
 
 
199 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.631803  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3142  putative transport transmembrane protein  56.28 
 
 
199 aa  169  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.895502 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7181  phosphoesterase PA-phosphatase related  43 
 
 
200 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.495224 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0055  undecaprenyl-diphosphatase  45 
 
 
200 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5310  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.86 
 
 
193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4126  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.74 
 
 
200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2151  phosphoesterase PA-phosphatase related  41 
 
 
200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0021  PAP2 family protein  41.45 
 
 
220 aa  124  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1745  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.71 
 
 
200 aa  123  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000013201  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5144  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.24 
 
 
193 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.418919  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5715  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.24 
 
 
193 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.134003 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4524  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.24 
 
 
193 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.242648  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3165  undecaprenyl-diphosphatase  42.24 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4984  phosphoesterase, PA-phosphatase related  41.61 
 
 
193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3127  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.61 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.634869  normal  0.862887 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1017  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.48 
 
 
224 aa  111  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0729132  normal  0.570341 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0937  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.99 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0998  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.99 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51948  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0969  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.99 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0901  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.99 
 
 
224 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0019  PAP2 family protein  39.33 
 
 
198 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1169  PAP2 family protein  39.66 
 
 
211 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1449  PAP2 family protein  39.33 
 
 
198 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0023  PAP2 family protein  39.66 
 
 
211 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0023  PAP2 family protein  39.33 
 
 
198 aa  107  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1526  PAP2 family protein  39.66 
 
 
211 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0025  PAP2 family protein  39.33 
 
 
198 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0343161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1634  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.38 
 
 
201 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.550126  decreased coverage  0.000150878 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0994  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.63 
 
 
198 aa  102  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485972  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.15 
 
 
198 aa  101  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.15 
 
 
198 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00808  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.15 
 
 
198 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2801  Undecaprenyl-diphosphatase  34.15 
 
 
198 aa  100  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185163  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2676  bacitracin transport permease protein bcrc  34.1 
 
 
199 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0902  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.15 
 
 
198 aa  100  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0843231  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2801  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.15 
 
 
198 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.907509 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0868  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.66 
 
 
198 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00825  hypothetical protein  34.15 
 
 
198 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2635  bacitracin transport permease protein bcrc  33.53 
 
 
199 aa  97.8  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183943 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2678  Pap2 superfamily protein, putative  34.3 
 
 
199 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2489  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.26 
 
 
199 aa  92.8  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0315773  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.98 
 
 
202 aa  91.7  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.130415 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2665  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  32.37 
 
 
199 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160204 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2391  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  32.37 
 
 
199 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193299  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2651  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.56 
 
 
201 aa  89.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1557  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.56 
 
 
201 aa  89.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2736  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.56 
 
 
201 aa  89.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.37805  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2716  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  31.79 
 
 
199 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.179676  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0272  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.79 
 
 
188 aa  87.4  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1041  hypothetical protein  66.67 
 
 
152 aa  87.4  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2430  PAP2 family protein  31.79 
 
 
199 aa  86.3  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000481219  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0918  hypothetical protein  65.22 
 
 
139 aa  87  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1924  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.08 
 
 
180 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2194  PAP2 family phosphatase  32 
 
 
183 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000351549  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0495  PAP2 superfamily protein  33.58 
 
 
195 aa  79.3  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0399  phosphatase  31.33 
 
 
187 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.556092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2329  PAP2 family protein  32.05 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.401849  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2508  PAP2 family protein  32.05 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2523  PAP2 family protein  32.05 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000225597 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2631  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.6 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1713  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.17 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.118972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2292  phosphatase, PAP2 family protein  31.21 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000588398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2759  bacitracin transport permease protein bcrc  31.29 
 
 
199 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0828321  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2785  bacitracin transport permease  30.71 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0666  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  50 
 
 
160 aa  72  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2794  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.81 
 
 
199 aa  72  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.755209  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0931  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.94 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2497  bacitracin transport permease  31.79 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202307  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5571  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.3 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0212028  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2053  phosphoesterase PA-phosphatase related  32 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.400178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2248  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  31.54 
 
 
182 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2462  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  30.46 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0841769  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3756  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.76 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0103395  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1480  undecaprenyl-diphosphatase  42.39 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00409552  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3725  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.34 
 
 
158 aa  61.2  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1173  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.81 
 
 
183 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0920806  normal  0.0722851 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1456  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.03 
 
 
192 aa  53.9  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13960  membrane-associated phospholipid phosphatase  33.33 
 
 
390 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66242  normal  0.948702 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.04 
 
 
185 aa  53.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0425  undecaprenyl-diphosphatase  28.85 
 
 
203 aa  52.4  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1131  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.69 
 
 
198 aa  52.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3318  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.9 
 
 
208 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0711194  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1553  undecaprenyl-diphosphatase  35.61 
 
 
207 aa  52  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6467  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.56 
 
 
232 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.555163 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0783  PAP2 family protein  27.2 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078196  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0463  Undecaprenyl-diphosphatase  27.15 
 
 
219 aa  50.1  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.282936  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0488  undecaprenyl-diphosphatase  32.48 
 
 
219 aa  49.7  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.263915 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2059  undecaprenyl-diphosphatase  33.63 
 
 
204 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0523127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.53 
 
 
178 aa  49.3  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0795  PAP2 family protein  26.4 
 
 
193 aa  48.9  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0176796  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1778  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.07 
 
 
182 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.67 
 
 
182 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.93 
 
 
205 aa  47.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4580  phosphoesterase, PA-phosphatase related protein  32.54 
 
 
197 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.715745  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>