83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2545 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2545  protein of unknown function DUF710  100 
 
 		 110 aa  211  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155146  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2627  hypothetical protein  56.67 
 
 		 117 aa  124  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1010  protein of unknown function DUF710  55.08 
 
 		 114 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1094  cell division protein ZapA  55.08 
 
 		 114 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2788  cell division protein ZapA  57.02 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.9281  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2370  hypothetical protein  57.94 
 
 		 110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.985049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4772  hypothetical protein  50.79 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.842395  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2788  hypothetical protein  46.62 
 
 		 133 aa  107  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.899312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2311  cell division protein ZapA  55.08 
 
 		 108 aa  105  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1535  cell division protein ZapA  74.24 
 
 		 147 aa  98.6  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17697  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2668  hypothetical protein  57.27 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0837  hypothetical protein  59.68 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5788  hypothetical protein  58.06 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0832  hypothetical protein  59.68 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1641  hypothetical protein  58.06 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.641819  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2506  hypothetical protein  58.06 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317879  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1846  hypothetical protein  58.06 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2457  hypothetical protein  58.06 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651634  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1033  hypothetical protein  58.06 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.244457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2329  hypothetical protein  58.06 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0493535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2957  hypothetical protein  58.06 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1026  hypothetical protein  58.06 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507925  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2462  hypothetical protein  58.06 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2374  hypothetical protein  58.06 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1185  hypothetical protein  58.06 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2215  hypothetical protein  54.41 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.60775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0993  protein of unknown function DUF710  52.94 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3505  cell division protein ZapA  50.72 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1130  hypothetical protein  36.71 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2402  hypothetical protein  47.37 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2211  protein of unknown function DUF710  42.11 
 
 		 105 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5970  hypothetical protein  30.39 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1182  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0322  cell division protein ZapA  32.41 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47360  hypothetical protein  33.01 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2669  protein of unknown function DUF710  42.25 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69030  hypothetical protein  30.39 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2539  cell division protein ZapA  38.33 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439557 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3434  hypothetical protein  35.53 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5226  hypothetical protein  32.38 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0318  hypothetical protein  32.38 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  26.53 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5110  hypothetical protein  30.48 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.30685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5263  hypothetical protein  30.48 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5028  hypothetical protein  31.43 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.767641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5437  cell division protein ZapA  33.01 
 
 		 105 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5202  hypothetical protein  30.48 
 
 		 106 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  31.82 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2772  hypothetical protein  43.08 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0652  hypothetical protein  43.94 
 
 		 113 aa  52  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0022  cell division protein ZapA  38.33 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3516  cell division protein ZapA  28.3 
 
 		 97 aa  50.1  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000386953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2723  cell division protein ZapA  36.62 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2768  protein of unknown function DUF710  36.67 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3068  hypothetical protein  29.69 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1825  protein of unknown function DUF710  38.33 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12217  hitchhiker  0.000000212758 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0626  hypothetical protein  37.1 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.517512  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3974  hypothetical protein  26.56 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0897  protein of unknown function DUF710  27.1 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3679  hypothetical protein  26.56 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0124  cell division protein ZapA  31.43 
 
 		 106 aa  47  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.946997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0127  hypothetical protein  36.67 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106139  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2038  hypothetical protein  36.67 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.251237  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2791  hypothetical protein  40.91 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.984817 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3505  cell division protein ZapA  28.33 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000440374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0829  hypothetical protein  28.33 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3335  cell division protein ZapA  28.33 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0618  cell division protein ZapA  28.33 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000185465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2540  putative cell division protein ZapA  30 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0775  hypothetical protein  28.33 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2725  hypothetical protein  29.69 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3215  hypothetical protein  28.33 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0041435  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3623  protein of unknown function DUF710  28.33 
 
 		 100 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3681  hypothetical protein  28.33 
 
 		 100 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0613  hypothetical protein  28.33 
 
 		 100 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.02493  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3805  hypothetical protein  28.33 
 
 		 100 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00222638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3280  protein of unknown function DUF710  40 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0411428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0845  hypothetical protein  36.67 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.062797  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0963  hypothetical protein  36.67 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552064  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3155  hypothetical protein  23.44 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2054  hypothetical protein  25.33 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911462  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02381  hypothetical protein  36.67 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>