74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4772 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4772  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  246  7e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.842395  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1094  cell division protein ZapA  61.9 
 
 
114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1010  protein of unknown function DUF710  61.9 
 
 
114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2788  hypothetical protein  54.89 
 
 
133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.899312  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1535  cell division protein ZapA  52.41 
 
 
147 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17697  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2627  hypothetical protein  52.38 
 
 
117 aa  115  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2788  cell division protein ZapA  51.59 
 
 
115 aa  107  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.9281  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2545  protein of unknown function DUF710  51.59 
 
 
110 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155146  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2311  cell division protein ZapA  45.31 
 
 
108 aa  94  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2370  hypothetical protein  68.25 
 
 
110 aa  93.2  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.985049  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2668  hypothetical protein  62.26 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0832  hypothetical protein  57.63 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0837  hypothetical protein  57.63 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464752  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5788  hypothetical protein  55.93 
 
 
104 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1641  hypothetical protein  55.93 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.641819  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1033  hypothetical protein  55.93 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.244457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2957  hypothetical protein  55.93 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3505  cell division protein ZapA  55.93 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2329  hypothetical protein  55.93 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0493535  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1185  hypothetical protein  55.93 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1026  hypothetical protein  55.93 
 
 
104 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507925  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2215  hypothetical protein  57.63 
 
 
104 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.60775  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2457  hypothetical protein  55.93 
 
 
104 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651634  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2506  hypothetical protein  55.93 
 
 
104 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317879  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1846  hypothetical protein  55.93 
 
 
104 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2462  hypothetical protein  55.93 
 
 
104 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252992  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2374  hypothetical protein  55.93 
 
 
104 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3434  hypothetical protein  40.85 
 
 
98 aa  60.1  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0993  protein of unknown function DUF710  54.24 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649993  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1130  hypothetical protein  45.61 
 
 
99 aa  58.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2539  cell division protein ZapA  40 
 
 
94 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0439557 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1182  hypothetical protein  40 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5028  hypothetical protein  30.33 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.767641  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69030  hypothetical protein  32.26 
 
 
104 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5970  hypothetical protein  31.18 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0318  hypothetical protein  35.71 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5226  hypothetical protein  35.71 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5437  cell division protein ZapA  37.88 
 
 
105 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5110  hypothetical protein  35.9 
 
 
106 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.30685  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5263  hypothetical protein  35.9 
 
 
106 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5202  hypothetical protein  35.9 
 
 
106 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2402  hypothetical protein  41.89 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2772  hypothetical protein  43.86 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2211  protein of unknown function DUF710  40.68 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0022  cell division protein ZapA  40 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  34.38 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47360  hypothetical protein  43.1 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0897  protein of unknown function DUF710  37.29 
 
 
101 aa  47.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2669  protein of unknown function DUF710  40.68 
 
 
105 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104034  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0322  cell division protein ZapA  31.71 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2723  cell division protein ZapA  40.68 
 
 
100 aa  47  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0626  hypothetical protein  40.68 
 
 
104 aa  47  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.517512  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1825  protein of unknown function DUF710  35.14 
 
 
100 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12217  hitchhiker  0.000000212758 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0652  hypothetical protein  38.98 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2768  protein of unknown function DUF710  36.67 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3679  hypothetical protein  29.69 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  37.93 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0124  cell division protein ZapA  31.08 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.946997  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3516  cell division protein ZapA  38.71 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000386953  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0127  hypothetical protein  40.35 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106139  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2038  hypothetical protein  40.35 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.251237  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  28.79 
 
 
106 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3974  hypothetical protein  29.69 
 
 
102 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3505  cell division protein ZapA  31.67 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000440374  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3068  hypothetical protein  29.69 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3215  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0041435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2791  hypothetical protein  37.29 
 
 
107 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.984817 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3335  cell division protein ZapA  33.33 
 
 
100 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0618  cell division protein ZapA  33.33 
 
 
100 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000185465  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0775  hypothetical protein  30 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3805  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00222638  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3623  protein of unknown function DUF710  33.33 
 
 
100 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36377  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3681  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0613  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.02493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>