66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2402 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2402  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  204  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2211  protein of unknown function DUF710  86.41 
 
 		 105 aa  179  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2669  protein of unknown function DUF710  84.47 
 
 		 105 aa  174  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0652  hypothetical protein  66.34 
 
 		 113 aa  147  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2791  hypothetical protein  61.39 
 
 		 107 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.984817 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2215  hypothetical protein  45.54 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.60775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3505  cell division protein ZapA  43.56 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0993  protein of unknown function DUF710  44.55 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5788  hypothetical protein  45.54 
 
 		 104 aa  89.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2374  hypothetical protein  44.55 
 
 		 104 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2462  hypothetical protein  44.55 
 
 		 104 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2457  hypothetical protein  44.55 
 
 		 104 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651634  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1846  hypothetical protein  44.55 
 
 		 104 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2506  hypothetical protein  44.55 
 
 		 104 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317879  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0832  hypothetical protein  44.55 
 
 		 104 aa  87.4  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1185  hypothetical protein  44.55 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2329  hypothetical protein  44.55 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0493535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2957  hypothetical protein  44.55 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1026  hypothetical protein  44.55 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1033  hypothetical protein  44.55 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.244457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1641  hypothetical protein  44.55 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.641819  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0837  hypothetical protein  44.55 
 
 		 104 aa  86.7  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2723  cell division protein ZapA  37.89 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2038  hypothetical protein  31.63 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.251237  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0127  hypothetical protein  31.63 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106139  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2627  hypothetical protein  45.16 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2545  protein of unknown function DUF710  44.26 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155146  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0322  cell division protein ZapA  36.46 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1130  hypothetical protein  36 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2788  hypothetical protein  44.44 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.899312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1825  protein of unknown function DUF710  34.78 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12217  hitchhiker  0.000000212758 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47360  hypothetical protein  36.46 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2370  hypothetical protein  41.27 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.985049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2311  cell division protein ZapA  37.27 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3434  hypothetical protein  38.71 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  37.68 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1094  cell division protein ZapA  41.94 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1010  protein of unknown function DUF710  41.94 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0626  hypothetical protein  28.87 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.517512  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0633  hypothetical protein  31.07 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0022  cell division protein ZapA  32.32 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4772  hypothetical protein  42.37 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.842395  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2788  cell division protein ZapA  38.71 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.9281  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3516  cell division protein ZapA  35 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000386953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2772  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3679  hypothetical protein  30.99 
 
 		 102 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0684  cell division protein ZapA  25.51 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000000536576  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5970  hypothetical protein  32.29 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  33.8 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69030  hypothetical protein  32.29 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3974  hypothetical protein  30.99 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1535  cell division protein ZapA  37.7 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17697  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  31.71 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3068  hypothetical protein  32.39 
 
 		 102 aa  43.5  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4027  cell division protein ZapA  30.21 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2280  protein of unknown function DUF710  27.66 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.954404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5437  cell division protein ZapA  31.96 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3215  hypothetical protein  28.4 
 
 		 100 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0041435  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1599  hypothetical protein  31.11 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2954  hypothetical protein  31.11 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3505  cell division protein ZapA  30.77 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000440374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3335  cell division protein ZapA  30.77 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0618  cell division protein ZapA  30.77 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000185465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0285  hypothetical protein  32.31 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.426663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2725  hypothetical protein  30.99 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0775  hypothetical protein  30.77 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>