113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0322 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_0322  cell division protein ZapA  100 
 
 
101 aa  204  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5970  hypothetical protein  83.51 
 
 
104 aa  173  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69030  hypothetical protein  83.51 
 
 
104 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47360  hypothetical protein  80.61 
 
 
104 aa  170  6.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5437  cell division protein ZapA  79.8 
 
 
105 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5226  hypothetical protein  74.75 
 
 
109 aa  150  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5028  hypothetical protein  75 
 
 
106 aa  150  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.767641  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0318  hypothetical protein  74.75 
 
 
109 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5110  hypothetical protein  74 
 
 
106 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.30685  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5202  hypothetical protein  73 
 
 
106 aa  146  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5263  hypothetical protein  73 
 
 
106 aa  146  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3434  hypothetical protein  51.96 
 
 
98 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2768  protein of unknown function DUF710  49.49 
 
 
104 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1825  protein of unknown function DUF710  43 
 
 
100 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12217  hitchhiker  0.000000212758 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1130  hypothetical protein  47.31 
 
 
99 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  43.3 
 
 
103 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3516  cell division protein ZapA  46.32 
 
 
97 aa  86.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000386953  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2539  cell division protein ZapA  58.82 
 
 
94 aa  86.7  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0439557 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2772  hypothetical protein  49.32 
 
 
97 aa  82.8  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1182  hypothetical protein  47.37 
 
 
96 aa  80.5  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0124  cell division protein ZapA  42.42 
 
 
106 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.946997  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02381  hypothetical protein  45.74 
 
 
99 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0022  cell division protein ZapA  45.74 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0626  hypothetical protein  40.45 
 
 
104 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.517512  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3280  protein of unknown function DUF710  42.39 
 
 
98 aa  73.2  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0411428  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2723  cell division protein ZapA  46.27 
 
 
100 aa  71.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0963  hypothetical protein  45.21 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552064  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0845  hypothetical protein  45.21 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.062797  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2038  hypothetical protein  32.98 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.251237  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0127  hypothetical protein  32.98 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106139  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0897  protein of unknown function DUF710  39.18 
 
 
101 aa  67  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4027  cell division protein ZapA  39.42 
 
 
111 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2370  hypothetical protein  32.67 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.985049  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2215  hypothetical protein  36.26 
 
 
104 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.60775  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0993  protein of unknown function DUF710  35.16 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649993  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3505  cell division protein ZapA  35.16 
 
 
104 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0652  hypothetical protein  37.23 
 
 
113 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2788  hypothetical protein  40.62 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.899312  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0832  hypothetical protein  32.22 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2402  hypothetical protein  36.46 
 
 
105 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1185  hypothetical protein  32.22 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2329  hypothetical protein  32.22 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0493535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2957  hypothetical protein  32.22 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1026  hypothetical protein  32.22 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507925  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1033  hypothetical protein  32.22 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.244457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1641  hypothetical protein  32.22 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.641819  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2211  protein of unknown function DUF710  35.42 
 
 
105 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1268  hypothetical protein  32.97 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1846  hypothetical protein  31.11 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2506  hypothetical protein  31.11 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317879  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2457  hypothetical protein  31.11 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651634  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3679  hypothetical protein  31.88 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  34.25 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2462  hypothetical protein  31.11 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252992  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2374  hypothetical protein  31.11 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2669  protein of unknown function DUF710  35.42 
 
 
105 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104034  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5788  hypothetical protein  31.11 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0837  hypothetical protein  31.11 
 
 
104 aa  52  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464752  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2791  hypothetical protein  33.33 
 
 
107 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.984817 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2545  protein of unknown function DUF710  38.98 
 
 
110 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155146  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1535  cell division protein ZapA  38.71 
 
 
147 aa  51.2  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17697  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2725  hypothetical protein  35.62 
 
 
102 aa  51.2  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3296  Z-ring-associated protein  28.57 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000920152  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3293  Z-ring-associated protein  28.57 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000277153  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3219  Z-ring-associated protein  28.57 
 
 
109 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000367602  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3974  hypothetical protein  31.51 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1094  cell division protein ZapA  28.97 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1010  protein of unknown function DUF710  28.97 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3506  protein of unknown function DUF710  34.09 
 
 
100 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02742  cytokinetic ring-localizing protein  28.09 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000149347  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0782  protein of unknown function DUF710  28.09 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  5.86222e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02705  hypothetical protein  28.09 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000185889  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3069  Z-ring-associated protein  28.09 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.6674200000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3238  Z-ring-associated protein  28.09 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000274743  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0799  Z-ring-associated protein  28.09 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000567069  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3044  Z-ring-associated protein  28.09 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000044208  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3331  Z-ring-associated protein  28.09 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000646117  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4203  Z-ring-associated protein  28.09 
 
 
109 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359174  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2627  hypothetical protein  40.98 
 
 
117 aa  48.9  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2311  cell division protein ZapA  33.33 
 
 
108 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0613  hypothetical protein  30.3 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.02493  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3681  hypothetical protein  30.3 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3805  hypothetical protein  30.3 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00222638  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3623  protein of unknown function DUF710  30.3 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36377  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0543  Z-ring-associated protein  24.47 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  25.56 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4772  hypothetical protein  31.71 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.842395  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2788  cell division protein ZapA  36.67 
 
 
115 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.9281  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0720  hypothetical protein  31.63 
 
 
119 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3068  hypothetical protein  30.43 
 
 
102 aa  47  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3329  Z-ring-associated protein  25.53 
 
 
109 aa  47  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000688409  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0829  hypothetical protein  27.78 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0446  Z-ring-associated protein  24.47 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00725856  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5999  hypothetical protein  38.24 
 
 
127 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0178074 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3470  hypothetical protein  37.31 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0249302  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3473  Z-ring-associated protein  23.4 
 
 
109 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3155  hypothetical protein  28.99 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3592  Z-ring-associated protein  23.4 
 
 
109 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.33654  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3215  hypothetical protein  28.79 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0041435  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3921  Z-ring-associated protein  24.47 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000155243  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>