74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2370 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2370  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  218  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.985049  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2788  cell division protein ZapA  60.19 
 
 
115 aa  120  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.9281  normal  0.0410821 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2627  hypothetical protein  55.26 
 
 
117 aa  118  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2311  cell division protein ZapA  59.05 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2545  protein of unknown function DUF710  57.94 
 
 
110 aa  107  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155146  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4772  hypothetical protein  50.41 
 
 
126 aa  100  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.842395  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1010  protein of unknown function DUF710  49.14 
 
 
114 aa  94.7  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1094  cell division protein ZapA  49.14 
 
 
114 aa  94.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2788  hypothetical protein  60 
 
 
133 aa  92  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.899312  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1535  cell division protein ZapA  68.25 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17697  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2668  hypothetical protein  66.67 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3434  hypothetical protein  36.54 
 
 
98 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5788  hypothetical protein  55.56 
 
 
104 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0832  hypothetical protein  55.56 
 
 
104 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0837  hypothetical protein  55.56 
 
 
104 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464752  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1641  hypothetical protein  55.56 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.641819  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2329  hypothetical protein  55.56 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0493535  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1026  hypothetical protein  55.56 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2957  hypothetical protein  55.56 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1033  hypothetical protein  55.56 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.244457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1185  hypothetical protein  55.56 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2462  hypothetical protein  55.56 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252992  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1846  hypothetical protein  55.56 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2374  hypothetical protein  55.56 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2506  hypothetical protein  55.56 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317879  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2457  hypothetical protein  55.56 
 
 
104 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651634  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5970  hypothetical protein  34.91 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5226  hypothetical protein  34.91 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0318  hypothetical protein  34.91 
 
 
109 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69030  hypothetical protein  34.91 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5437  cell division protein ZapA  37.62 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5028  hypothetical protein  37.62 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.767641  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2539  cell division protein ZapA  46.77 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0439557 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2215  hypothetical protein  53.97 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.60775  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0993  protein of unknown function DUF710  53.97 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649993  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3505  cell division protein ZapA  53.12 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5110  hypothetical protein  36.63 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.30685  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1182  hypothetical protein  44.26 
 
 
96 aa  61.6  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5202  hypothetical protein  35.64 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5263  hypothetical protein  35.64 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2768  protein of unknown function DUF710  31.63 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0322  cell division protein ZapA  34.91 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1825  protein of unknown function DUF710  30.77 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12217  hitchhiker  0.000000212758 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2772  hypothetical protein  41.94 
 
 
97 aa  58.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47360  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0626  hypothetical protein  37.33 
 
 
104 aa  57.4  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.517512  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1130  hypothetical protein  35.64 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0022  cell division protein ZapA  35.29 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0124  cell division protein ZapA  37.5 
 
 
106 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.946997  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0652  hypothetical protein  37.5 
 
 
113 aa  52.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2402  hypothetical protein  41.27 
 
 
105 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2723  cell division protein ZapA  33.33 
 
 
100 aa  52  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2211  protein of unknown function DUF710  39.68 
 
 
105 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.784079 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2791  hypothetical protein  37.25 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.984817 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0897  protein of unknown function DUF710  29.41 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2669  protein of unknown function DUF710  39.68 
 
 
105 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104034  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  37.29 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3308  hypothetical protein  31.25 
 
 
106 aa  47  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.274755  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3280  protein of unknown function DUF710  40 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0411428  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4027  cell division protein ZapA  32.67 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3068  hypothetical protein  27.63 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0845  hypothetical protein  37.93 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.062797  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0963  hypothetical protein  37.93 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552064  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3516  cell division protein ZapA  29 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000386953  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0604  hypothetical protein  30.16 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02381  hypothetical protein  39.66 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0127  hypothetical protein  33.87 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106139  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3679  hypothetical protein  26.32 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2038  hypothetical protein  33.87 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.251237  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3974  hypothetical protein  29.03 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0829  hypothetical protein  26.98 
 
 
102 aa  40.4  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3505  cell division protein ZapA  23.68 
 
 
100 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000440374  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3215  hypothetical protein  23.68 
 
 
100 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0041435  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0775  hypothetical protein  23.68 
 
 
100 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>