90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0963 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0963  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  197  5e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.552064  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0845  hypothetical protein  97.98 
 
 
99 aa  193  6e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.062797  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02381  hypothetical protein  65.31 
 
 
99 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3280  protein of unknown function DUF710  65.26 
 
 
98 aa  118  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0411428  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5202  hypothetical protein  47.78 
 
 
106 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5263  hypothetical protein  47.78 
 
 
106 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5226  hypothetical protein  52.05 
 
 
109 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0318  hypothetical protein  52.05 
 
 
109 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.450253 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5028  hypothetical protein  49.33 
 
 
106 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.767641  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5110  hypothetical protein  46.67 
 
 
106 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.30685  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5437  cell division protein ZapA  51.39 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0561705 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1825  protein of unknown function DUF710  36.73 
 
 
100 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12217  hitchhiker  0.000000212758 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5970  hypothetical protein  41.9 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2768  protein of unknown function DUF710  38.54 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0496376  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69030  hypothetical protein  48.61 
 
 
104 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0322  cell division protein ZapA  45.21 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.222691  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47360  hypothetical protein  45.83 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3516  cell division protein ZapA  48.53 
 
 
97 aa  67.4  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000386953  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3434  hypothetical protein  55 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2539  cell division protein ZapA  43.24 
 
 
94 aa  67.4  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0439557 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2772  hypothetical protein  41.67 
 
 
97 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1182  hypothetical protein  41.41 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0127  hypothetical protein  33.7 
 
 
107 aa  62.8  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106139  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2038  hypothetical protein  33.7 
 
 
107 aa  62.8  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.251237  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0626  hypothetical protein  36.26 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.517512  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2576  hypothetical protein  32.29 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.105055  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4027  cell division protein ZapA  44.44 
 
 
111 aa  57  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2723  cell division protein ZapA  43.94 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0124  cell division protein ZapA  39.39 
 
 
106 aa  56.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.946997  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0897  protein of unknown function DUF710  33.33 
 
 
101 aa  53.9  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1130  hypothetical protein  37.5 
 
 
99 aa  50.8  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2457  hypothetical protein  38.24 
 
 
104 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.651634  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2506  hypothetical protein  38.24 
 
 
104 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317879  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2374  hypothetical protein  38.24 
 
 
104 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1846  hypothetical protein  38.24 
 
 
104 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2462  hypothetical protein  38.24 
 
 
104 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252992  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5788  hypothetical protein  38.24 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0832  hypothetical protein  36.23 
 
 
104 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0022  cell division protein ZapA  31.46 
 
 
105 aa  47  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1185  hypothetical protein  36.23 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0837  hypothetical protein  36.76 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464752  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1033  hypothetical protein  36.23 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.244457  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3329  Z-ring-associated protein  27.47 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000688409  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1641  hypothetical protein  36.23 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.641819  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1026  hypothetical protein  36.23 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00507925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2957  hypothetical protein  36.23 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2329  hypothetical protein  36.23 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0493535  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0543  Z-ring-associated protein  28.57 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0446  Z-ring-associated protein  28.57 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00725856  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3044  Z-ring-associated protein  27.47 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000044208  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0782  protein of unknown function DUF710  27.47 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  5.86222e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3219  Z-ring-associated protein  27.47 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000367602  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3293  Z-ring-associated protein  27.47 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000277153  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0799  Z-ring-associated protein  27.47 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000567069  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4203  Z-ring-associated protein  27.47 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000359174  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3331  Z-ring-associated protein  27.47 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000646117  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0993  protein of unknown function DUF710  37.31 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649993  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3296  Z-ring-associated protein  27.47 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0000920152  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3238  Z-ring-associated protein  27.47 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000274743  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3069  Z-ring-associated protein  27.47 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.6674200000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02742  cytokinetic ring-localizing protein  27.47 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000149347  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3473  Z-ring-associated protein  28.57 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02705  hypothetical protein  27.47 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000185889  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0821  cell division protein ZapA  35.82 
 
 
91 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3505  cell division protein ZapA  37.31 
 
 
104 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.214372  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3592  Z-ring-associated protein  28.57 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.33654  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2215  hypothetical protein  37.31 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.60775  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2635  cell division protein ZapA  34.33 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000609158  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2370  hypothetical protein  37.93 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.985049  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3921  Z-ring-associated protein  28.57 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000155243  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3974  hypothetical protein  26.97 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1104  hypothetical protein  34.83 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155521  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1268  hypothetical protein  30.34 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3679  hypothetical protein  26.97 
 
 
102 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2669  protein of unknown function DUF710  27.27 
 
 
105 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104034  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0861  Z-ring-associated protein  27.47 
 
 
109 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000455122  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3825  Z-ring-associated protein  27.47 
 
 
109 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000023514  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0858  Z-ring-associated protein  27.47 
 
 
109 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  2.48615e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1535  cell division protein ZapA  36.67 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17697  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2725  hypothetical protein  28.26 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0652  hypothetical protein  28.77 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2627  hypothetical protein  41.67 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0618  cell division protein ZapA  28.42 
 
 
100 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000185465  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3335  cell division protein ZapA  28.42 
 
 
100 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000188037  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1010  protein of unknown function DUF710  35.21 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3215  hypothetical protein  28.42 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0041435  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1094  cell division protein ZapA  35.21 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3505  cell division protein ZapA  28.42 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000440374  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3068  hypothetical protein  26.97 
 
 
102 aa  40  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000570749  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0775  hypothetical protein  28.42 
 
 
100 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>