137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1083 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1083  inner membrane protein  100 
 
 		 130 aa  253  6e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03089  hypothetical protein  51.46 
 
 		 115 aa  114  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0570  hypothetical protein  47.12 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000137123  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2409  hypothetical protein  54.12 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218775  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1791  hypothetical protein  45.19 
 
 		 122 aa  97.8  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.379134  hitchhiker  0.00000106844 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2011  hypothetical protein  39.82 
 
 		 122 aa  97.1  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1308  hypothetical protein  39.81 
 
 		 123 aa  94  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.060954  normal  0.0507678 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2854  hypothetical protein  43.27 
 
 		 139 aa  93.2  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.44368  hitchhiker  0.000000266441 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2304  hypothetical protein  42.27 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000252834  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1924  hypothetical protein  40.52 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0750  hypothetical protein  41.23 
 
 		 158 aa  88.6  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1506  hypothetical protein  42.11 
 
 		 122 aa  87  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0208713  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1355  hypothetical protein  40.52 
 
 		 139 aa  86.7  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3459  protein of unknown function DUF454 transmembrane  43.33 
 
 		 117 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2579  hypothetical protein  37.82 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2617  hypothetical protein  45.57 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000233192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2692  hypothetical protein  45.57 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000125494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1226  hypothetical protein  41.44 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2886  hypothetical protein  41.44 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2688  hypothetical protein  37.72 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1847  hypothetical protein  36.07 
 
 		 140 aa  84  6e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.331022  normal  0.61235 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2576  hypothetical protein  45.57 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000163875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1767  protein of unknown function DUF454  45.57 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000313735  hitchhiker  0.0045444 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00419  conserved inner membrane protein  35.65 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0145391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3142  protein of unknown function DUF454  35.65 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0034209  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0221  hypothetical protein  35.94 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00424  hypothetical protein  35.65 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0180358  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0545  hypothetical protein  35.65 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0504  hypothetical protein  35.65 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0827221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3148  hypothetical protein  35.65 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.102596  normal  0.239123 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0511  hypothetical protein  35.65 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000222622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2662  hypothetical protein  39.64 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.437661 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4416  hypothetical protein  37.93 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.799687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2134  hypothetical protein  34.45 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.352277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2172  hypothetical protein  32.52 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0917  hypothetical protein  35.61 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140199  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0267  hypothetical protein  50.65 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2237  hypothetical protein  40.21 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000431925  hitchhiker  0.000763101 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0558  hypothetical protein  35.65 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3917  hypothetical protein  44.87 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0768247  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1393  hypothetical protein  48.19 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0948  hypothetical protein  39.33 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.368818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3807  hypothetical protein  45.35 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253442  hitchhiker  0.00000298507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1466  hypothetical protein  45.35 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0586  hypothetical protein  39.33 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0526  hypothetical protein  39.33 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0532  hypothetical protein  39.33 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0542  hypothetical protein  39.33 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4518  hypothetical protein  46.99 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.359562  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1642  hypothetical protein  48.84 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.96968  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4024  hypothetical protein  46.99 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163458 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4111  hypothetical protein  34.86 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2256  hypothetical protein  34.78 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000852478  normal  0.354843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2328  hypothetical protein  34.78 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000332693  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2448  hypothetical protein  34.78 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000286894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2383  hypothetical protein  34.41 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000577354  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3890  hypothetical protein  45.35 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.482598  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45850  hypothetical protein  45.35 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1810  hypothetical protein  43.37 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0936  hypothetical protein  41.05 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1165  hypothetical protein  35.64 
 
 		 116 aa  72.8  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0526  hypothetical protein  40 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.63722  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3740  hypothetical protein  43.82 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.468258  normal  0.0114181 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1363  protein of unknown function DUF454  37.04 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000761785 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1520  hypothetical protein  44.33 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.757291  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1925  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.946334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1530  hypothetical protein  42.11 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.225714 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04126  hypothetical protein  34.68 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0292  hypothetical protein  42.35 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.176418 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2936  protein of unknown function DUF454  32.73 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.252831  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1072  protein of unknown function DUF454  36.56 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1701  hypothetical protein  37.74 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0681358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0014  hypothetical protein  43.42 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2610  hypothetical protein  36.45 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.287981 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1454  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0600527 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2850  protein of unknown function DUF454  41.46 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000168142  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002883  hypothetical protein  38.96 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.2374  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1004  hypothetical protein  37.23 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0490  protein of unknown function DUF454  38.67 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0000104879  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0557  protein of unknown function DUF454  41.33 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0642321  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3311  protein of unknown function DUF454  38.55 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.639511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1817  hypothetical protein  30.58 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2214  hypothetical protein  34.86 
 
 		 202 aa  63.9  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.345545  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3232  hypothetical protein  45.76 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34095  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1558  protein of unknown function DUF454  38.46 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1017  hypothetical protein  38.61 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.520138  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2869  hypothetical protein  35.71 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0868079  normal  0.160086 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2522  hypothetical protein  33.61 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1501  hypothetical protein  41.94 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3478  protein of unknown function DUF454  32.48 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545002 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1113  hypothetical protein  42.11 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1282  hypothetical protein  34.45 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1103  hypothetical protein  34.58 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.827298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4856  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.715473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0524  hypothetical protein  41.33 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.286047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3072  hypothetical protein  45.45 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0894433  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0553  protein of unknown function DUF454  41.33 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1133  hypothetical protein  42.06 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.88473  unclonable  0.0000000168817 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1041  hypothetical protein  36.25 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.667092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03399  hypothetical protein  38.71 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>